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- 2017-09-11 发布于北京
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一个新的人NFBD1启动子的鉴定与分析
【摘要】 目的: 鉴定分析NFBD1启动子,为进一步研究其转录调控奠定基础. 方法: 综合应用生物信息学分析和异构体特异性的巢式RTPCR技术鉴定NFBD1转录起始位点和转录变异体;高保真PCR方法扩增NFBD1基因启动子区域并分别定向克隆入pGL3basic和pGL3enhancer载体,构建NFBD1启动子荧光素酶报告基因重组体;荧光素酶分析检测启动子活性;生物信息学方法预测转录因子结合位点. 结果: 鉴定了一个新的NFBD1转录起始位点和转录变异体,构建了2个含有长度分别为2.5和1.2 kb的NFBD1启动子序列的荧光素酶报告基因重组体以及2个相应的含有外源增强子的NFBD1启动子荧光素酶报告基因重组体. 启动子活性分析表明,该启动子区域具有启动子活性,且能被外源增强子有效驱动,是一个新的人NFBD1启动子. 转录因子结合位点预测分析表明,该启动子区域缺乏典型的CCAAT盒和GC盒,但含有TATA盒以及STAT1, MZF1和MAZ等潜在的转录因子结合位点. 结论: 鉴定了一个新的NFBD1启动子.
【关键词】 NFBD1 启动区(遗传学) 增强子元件(遗传学) 转录调控
0引言
NFBD1(a nuclear factor with BRCT domain 1),也称MDC1(mediator
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