第四节基因组分析列举：水稻基因组分析.pdfVIP

浙江大学/bioinplant/ 《生物信息学札记》 樊龙江 第四节 基因组分析列举：水稻基因组分析 本节将结合我们近年来的一些研究结果，重点对第一个被基因组测序的作物 ——水稻的基因组研究和分析结果进行介绍。 水稻是第一个被全基因组测序的作物。亚洲栽培稻（Oryza sativa ）共有2 个亚种（籼稻和粳稻），其中一个粳稻品种“日本晴”分别通过全基因组鸟枪法（Goff et al, 2002 ）和逐步克隆方法(Sasaki et al, 2002; Feng et al, 2002; The Rice Chromosome 10 Sequencing Consortium, 2003; The Rice Genome Sequencing Project, 2005)测序，另一个籼稻品种“9311”通过全基因组鸟枪法测 序(Yu et al, 2002; Yu et al, 2005)。除了核基因组外，水稻的叶绿体基因组序列 早在15 年前就已测序完成(Hiratsuka et al, 1989) ，同时，其线粒体基因组最近 也被测序完成（Notsu et al. 2002 ）。 在获得基因组序列后，一项艰巨的研究任