基于模糊理论预测CpG岛新方法.pdfVIP

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第 7卷 第2期 生 物 信 息 学 V01.7 No.2 2009年 06月 ChinaJournalofBioinformafics June,2OO9 基于模糊理论预测 CpG岛新方法 王金龙,苏建忠,王芳,崔颖,张岩 (哈尔滨医科大学生物信息科学与技术学院,哈尔滨 150081) 摘要:启动子区域的CoG岛的异常甲基化是识别癌症的重要标志之一。 目前已经建立的一些cpG岛的预测思想和方法都有 自身的缺点,基于模糊理论的预测思想从贴进度的角度来判定cpG岛,能更容易地找到被以往方法所忽略的具有更多生物学 意义的CoG岛。本研究通过构建属于cpG岛集合的隶属函数,计算候选序列的隶属度,找出所有的可接受隶属程度的CGO 岛。将该方法应用于UCSC数据库中的一段序列(18.chr131623510_一1000)进行预测,发现提高了预测的精确度。 可见应用模糊理论预测cGo 岛具有一定的可行

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