鸡传染性法氏囊病毒基因组A节段编码前体多聚蛋白的遗传踪迹分析.pdfVIP

第 34卷 第 1期 中 国 预 防 兽 医 学 报 VoI．34．NO．1 2012 年 1月 ChineseJournalofPreventiveVeterinaryMedicine Jan． 2012 doi：10．3969~．issn．1008—0589．2012．01．07 鸡传染性法氏囊病毒基因组 A节段编码前体 多聚蛋 白的遗传踪迹分析 侯仲杰 ，王靖飞，付朝阳，高宏雷，高玉龙 ，祁小乐，郭莹莹，王笑梅 (中国农业科学院哈尔滨兽医研究所 兽医生物技术国家重点实验室 ，黑龙江 哈尔滨 150001) 摘 要：为研究鸡传染性法氏囊病毒(IBDV)毒力变异的分子机理，本实验采用进化踪迹分析方法对GenBank 中登录的28个毒力不同的IBDV参考病毒株的基 因组A节段编码的前体 多聚蛋 白(NH2．pVP2．VP4．VP3．COOH)推 导的氨基酸序列进行分析。结果表明超强 IBDV与标准IBDV的差异位点集中在第299位、451位、680位、715 位和 751位氨基酸上 ；致弱IBDV与标准IBDV的差异位点在第242位 、253位 、330位和 981位氨基酸。该结果 为进一步研究IBDV的毒力变异奠定基础 。 关键词 ：鸡传染性法氏囊病毒 ；前体多聚蛋 白；毒力变异 ；进化踪迹分析 中图分类号 ：$852．65 文献标识码 ：A 文章编号 ：1008．0589(2012)01—0028．05 Evolutionarytraceanalysisoftheaminosequencesof precursorpolyproteinencodedbythegenomesegmentA of infectiousbursaIdiseasevirus HOUZhong-jie，WANGJing—fei，FUChao—yang，GAOHong-lei，GAOYu—long，QIXiao．1e， GUO Ying—ying，W ANG Xiao—mei (StateKeyLaboratoryofVeterinaryBiotechnology，Ha~inVeterinaryResearchInstitute，ChineseAcademyof AgriculutralSciences，Hrabin150001，China) Abstract：Tounderstandmolecularbasisforvirulencedivergenceofinfectiousbursa1diseaseviurs(IBDV)．atotalof28 aminosequencesofprecursorpolyprotein(NH2一pVP2prot—VP3一COOH)encodedbygenomesegmentA ofreferenceIBDV strains inGenBankwerecollectedandanalyzedusingthemethodofevolutionary ffaceanalysis．Theresultsfoundhtattheaminoacidsof precursorpolyproteinofveryviurlentIBDV differfrom thoseofclassicIBDV athtepositionsofaa299，aa451，aa680，aa715and aa751，whilethoseofattenuatedIBDV differfrom thoseofclassicIBDV athtepositionsofaa242，aa253，aa330andaa981．These resultsmightfacilitatefurtherthestudiesonrBDV viur lencedivergence． Keywords：infectiousbursa