典型农田土壤中硝化微生物的生理生态学研究.pdfVIP

环境微生物费源式掘与利用 in Mn dissolutionofsolubleMn2+induced bacteriaresulted92．8％0f bysulfur．oxidizing thereductiondissolutionofinsoluble bacteriacaused extraction，while Mn4+byiron—oxidizing 5．3％ofMnextraction．Theactionof bacteriaand combined sulfur-oxidizingiron—oxidizing extraction．Thechemicalsimulationof bacteriaassuredthemaximumMn bioleachingprocess demonstratedthe andXRD of residuesfurther mechanism analysisbioleaching bioleaching involved． Keywords：electrolyticresidues；Mnextraction；bioleaching manganese 典型农田土壤中硝化微生物的生理生态学研究 贾仲君 中国科学院南京土壤研究所 基于16SrRNA的研究表明，大约90％的环境微生物是“难培养微生物”，无法在实验 室获得纯菌株。因此，上世纪90年代以来，“难培养微生物”的生理代谢及其环境效应， 既是环境微生物领域的难点，也是热点。基于1958年DNA半保留复制著名实验的基本 思路，研究者于2000年提出了“稳定性同位素核酸探针”的概念，拓展了复杂环境难培养 微生物生理代谢的研究思路。 “稳定性同位素核酸探针”的基本概念是：采用“稳定性同位素”标记的¨C．底物培养复 杂环境样品(如土壤)，因为合成代谢是所有生命的基本特征之一，环境中利用了13C．底 物的微生物细胞物质如核酸DNA／RNA将被标记，通过超高速密度梯度离心，将13C一标记 的环境微生物核酸与未标记的环境微生物核酸分离，进一步分析13C．标记的DNA／RNA， 明确认识复杂环境中同化了标记底物的环境微生物作用者，深刻理解环境中难培养微生物 的作用。 硝化微生物生长缓慢，特别是氨氧化古菌极难培养。以硝化微生物群落为模式，结合 新一代454高通量测序，采用“稳定性同位素核酸探针”技术，我们研究了氨氧化细菌、 氨氧化古菌、以及亚硝酸氧化细菌在农田土壤硝化过程中的作用。研究结果表明细菌主导 了农田土壤硝化过程，古菌对硝化活性的贡献最多为1．5-23％。利用乃C02对典型农田土 壤进行动态培养，发现氨氧化细菌核酸DNA的标记程度随培养时间不断增加；而标记的 第十三次舍国环境微生物学术研讨会 要微生物作用者，氨氧化古菌与一株中嗜热氨氧化泉古菌(46。C)具有最近的系统进化 发育关系。通过计算土壤中标记的13C．氨氧化古菌数量，来源于海洋和温泉的两株古菌氨 氧化速率，根据三次重复的实验数据，我们推测氨氧化古菌对硝化过程的贡献最多为 1．5-23％。然而，古菌对硝化过程的贡献率仍须不断研究，特别是土壤氨氧化古菌的分离。 例如，尽管我们的实验表明土壤氨氧化古菌与中嗜热氨氧化泉古菌(46。C)亲缘关系最 近，然而，460C培养土壤5个月后，未能检测到土壤硝化活性。这一结果清楚表明：尽 管土壤和温泉中两种氨氧化古菌的基因序列具有高度的同源性，但其生理代谢规律可能具 有较大差异。进一步采用