马铃薯Y病毒福建分离物P1基因的分子变异和结构特征.pdfVIP

连 Hereditas(Beijing)2014年7,El，36(7)：713—722 www．chinagene．cn 研究报告 马铃薯Y病毒福建分离物 基因的分子变异和结构特征 史凤阳1，高芳銮 ，沈建国2，常飞 ，詹家绥 1．福建农林大学植物病毒研究所，福建省植物病毒学重点实验室，福州 350002； 2．福建出人境检验检疫局检验检疫技术中心，福州 350001 摘要：为揭示马铃薯Y病毒(Potatovirusy，PVY)P1基因的分子变异及结构特征，并查明福建分离物PJ基因的 变异来源。文章设计一对简并弓l物从感染PvY的马铃薯病叶扩增、克隆获得福建分离物 PJ基因的cDNA全长 序列，分析其核苷酸序列和氨基酸序列的特征，并采用贝叶斯法重建P 基因的系统发育树。结果显示，l2个福 建分离物均成功扩增出预期大小(约915bp)的特异性片段，尸J基因的核苷酸序列与已报道的PVY不同株系的核 苷酸序列一致性为73％～99％；QK44、XT02、XT08、LH05分离物的309nt位置均检测到一个强烈的重组信号。 l2个 PVY分离物中，P1蛋 白有 85个变异的氨基酸位点，表 明其高度变异；P1蛋 白的第41～275位是一个高度 保守的结构功能域，含有 3个保守的活性位点(H192、D2。。、V235)；系统发育分析显示，福建分离物形聚为 3种 不同的簇，其对应的卷 曲结构(Coiled．coildomain)和空间结构也不相同，表明不同株系型的PJ基因在系统发育 关系上分化较大。该研究结果表明PVYP1基因在核苷酸序列、氨基酸序列以及空间结构具有高度变异性，但 行使 P1蛋 白功能的活性位点所在的氨基酸(H192、D201和 V23)均高度保守；福建分离物 P 基因的变异源主要 来 自碱基突变和基 因重组。 关键词：马铃薯Y病毒；P1基因；变异；重组 SequencevariationofPIgeneinPotatovirusYisolatedfromFHjian Province FengyangShi，FangluanGao，JianguoShen，FeiChang，JiasuiZhan 1．KeyLaboratoryofPlantVirologyofFujianProvince，InstituteofPlantVirology，FujianAgricultureandForestryUniversity，Fuzhou 350002，China； 2．Inspection＆QuarantineTechnologyCenter，FujianExit-EntryInspectionandQuarantineBureau，Fuzhou350001，China Abstract： TounderstandthesequencevariationandtheputativeproteinstructureofP1geneinPotatovirusY(PvY) 收稿 日期 ：2014—03—20；修回 日期：2014～05—05 基金项 目：国家现代农业马铃薯产业技术体系(编号：CARS一1O)，福建省 自然科学基金项 目(编号：2013J01088)，福建省教育厅科技项 目(编号：JA12119)， 国家质检总局科技计划项 目 (编号：2013IK299，2013IK094)和福建出入境检验检疫局科技项 目(编号：FK2011-07，FK2007．07)资助 作者简介：史风阳，在读硕士研究生，专业方向：马铃薯病毒。E—mail：shifyang@126．tom； 高芳銮，在读博士研究生，专业方 向：马铃薯病毒 。E．mail：raindy@fafu．edu．cn； 史凤阳和高芳銮同为第一作者 。 通汛作者：詹家绥，教授，研究方向：病原群体遗传与进化。Email：jiasui．zhan@fafu．edu．cn 致 谢 ：马铃薯Y病毒毒源的采集得到福建省龙岩市农业科学研究所梁金平、张志勇和福建省长乐市农业局植保植检站陈宏以及本实验室 的祝雯博士和杨策、方治国同学等的大力帮助，在此表示感谢。 DOI：l0．3724／S J．1005．20l4．07l3 网络出版 时间：2014．5—19 11：04：28 URL：http：／／www．cnki．net／kcms／detail／11．1913．R2118．001．html 714