MADS_box基因家族基因重复及其功能多样性_吕山花.pdfVIP

植物学通报Chinese Bulletin of Botany2007, 24(1): 60-70, .. 综述 MADS-box基因家族基因重复及其功能的多样性 1, 2 2* 吕山花 ,孟征 1聊城大学农学院园艺工程系,聊城252059 2中国科学院植物研究所植物信号转导与代谢组学研究中心,北京100093 摘要 基因的重复(duplication)及其功能的多样性(diversification)为生物体新的形态进化提供了原材料。MADS-box基因 在植物(特别是被子植物)的进化过程中发生了大规模的基因重复事件而形成一个多基因家族。MADS-box基因家族的不同成 员在植物生长发育过程中起着非常重要的作用,在调控开花时间、决定花分生组织和花器官特征以及调控根、叶、胚珠及果 实的发育中起着广泛的作用。探讨MADS-box基因家族的进化历史有助于深入了解基因重复及随后其功能分化的过程和机制。 本文综述了MADS-box基因家族基因重复及其功能分化式样的研究进展。 关键词 MADS-box基因,基因重复,功能分化 吕山花,孟征 (2007). MADS-box基因家族基因重复及其功能的多样性.植物学通报 24, 60-70. 在生物体中经常发生基因、基因组片段或整套基 年来国际上关注的热点和研究的前沿问题之一。祖先 因组加倍(polyploidization)重复现象。对几种完成或接 基因发生基因重复事件后,最初重复基因的功能是完全 近完成全基因组测序的真细菌(eubacteria)、古细菌 冗余的(redundant)。在随后的进化过程中,重复基因在 (archaebacteria)和真核生物(eukaryotes)的基因组序列 生物体中可能面临以下3种不同的命运: (1)其中一个拷 分析、群体遗传学模拟和分子遗传学实验显示,在基因 贝(copy)保留了祖先基因的功能,而另外一个拷贝发生 组中存在大量的重复基因(Zhang, 2003)。早在1936了新功能化(neofunctionalization)而获得了新的功能; (2) 年, Bridges报道了一段染色体带的加倍引起基因重复, 其中一个拷贝发生了非功能化 而 从而导致果蝇眼睛严重变小的突变体(Bridges, 1936)。 成为假基因(pseudogene); (3)两个拷贝发生了亚功能化 到1970年Evolution by Gene Duplication一书的出版 (subfunctionalization),分担(partition)了祖先基因的功 才使得生物学家认识到基因重复在物种进化中的重要性 能, 而他们合起来的功能则涵盖了祖先基因功能 (Ohno, 1970)。但是直到20世纪90年代后期,大量基 因组测序工作开展之后,对基因重复的详细研究才得以 。探讨单个 进行。据推测, 70%-80%的被子植物在进化过程中某 基因家族的系统发育历史能够更加深入地了解在生物体 些位点(point)发生了加倍重复现象(Otto and Whitton, 进化过程中重复基因的作用和意义。 2000; Simillion et al., 2002; Blanc et al., 2003; Bow- 在众多的植物基因家族中,对MADS-box基因家族 ers et al., 2003; Paterson et al., 2004)。以拟南芥 的进化历史的研究相对比较深入。MADS-box基因编 (Arabidopsis thaliana)和水稻(Oryza sativa)为例,分别 码转录因子,在植物(特别是被子植物)进化过程中发生了 有90%和62%的位点(loci)发生了重复(Moore and 大量的基因重复事件, 从而形成了一个多基因家族 Purugganan, 2005)。