KNN方法在癌症中红外光谱检测的应用.pdfVIP

第27卷，第3期 光谱学与光谱分析 200 and March。2007 7年3月 SI)ectroscopySpectralAmlysis KNN方法在癌症中红外光谱检测中的应用 李 响1，李庆波1，徐怡庄孙，张广军1，吴瑾光2， 杨丽敏2，凌晓锋3，周孝思3，王健生4 1．北京航空航天大学仪器科学与光电工程学院，北京 100083 2．北京大学化学与分子工程学院，稀土材料化学及应用国家重点实验室，北京l00871 3．北京大学第三医院普外科，北京100083 4．西安交通大学第一医院外科，陕西西安710061 摘要红外光谱主要是研究分子中以化学键联结的原子之间的振动光谱，它能够在分子水平上揭示正常 组织和癌组织之间存在的差异。文章利用化学计量学中的有关知识通过计算机自动对未知样本光谱进行判 别分析。首先应用平滑处理，基线校正(SNV方法)，奇异值剔除(RHM方法)等算法对光谱数据进行预处 理，然后采用K一最近邻法(简称KNN法)实现未知样本的自动判别，提高了癌症红外光谱检测的准确度。文 章对63例胃组织样品进行了傅里叶变换红外光谱判别分析，与病理检验结果比较，准确度达到91．7％。 关键词KNN方法；癌症；FTIR；模式识别 中图分类号：R730．4文献标识码：A 文章编号：1000-059312007)03-0439一05 果[7‘121。 引 言 对试样组织进行光谱分析所用的数据是多维的，其中包 含着丰富的光谱特征信息，计算机对多维数据具有很强的模 癌症是一种严重危害人类健康乃至生命的疾病，它的发 式识别能力，因此本文以胃癌组织的傅里叶变换红外光谱检 生是一个多因素、多阶段、复杂渐进的过程。早期发现，早 测为例，对胃癌和癌旁正常组织的傅里叶变换中红外光谱进 期诊断，早期治疗是提高病人生存率的关键。在组织癌变过 行了KNN方法的模式识别应用研究，以进一步提高恶性肿 程中，分子水平上的变化一般早于细胞形态学方面的变化和 瘤中红外光谱早期诊断方法的判别效果。 机体症状的出现，然而现有影像学技术对分子水平上的变化 不敏感，难以利用这些变化诊断早期癌症。振动光谱法能够 1实验部分 灵敏地检测细胞分子生物化学上的变化，如探测细胞的生物 分子在构型、构象和含量上发生的变化，它在癌症形成初期 1．1标本取材和处理 就可以观察到分子结构的细微改变，同时由于肿瘤细胞内部 样品为北京大学第三医院和西安交通大学第一医院外科 物质在分子水平发生典型变化，所以红外光谱具有一定的客 手术切除标本，胃癌组织及胃正常组织共计63例，病理学检 观性和可重复性。因此，红外光谱法可以发展成一种简便、 查结果为胃癌37例，正常胃组织26例。标本离体后，样品 快速，准确的癌症早期诊断方法。 分为两部分，一部分福尔马林固定，石蜡包埋，HE染色，进 近年来，随着光谱技术与生物谱学研究的发展，光谱方 行常规病理学检查；另一部分放入液氮中保存，用于光谱研 法应用于肿瘤检测的研究逐渐成为国内外的热点课题[1卅。 究。 近年来应用中红外光谱法检测肿瘤的研究取得了长足的进 1．2仪器和方法 步。其中北京大学化学与分子工程