实时定量PCR技术应用常见问题解答—ABI.docVIP

实时定量PCR技术应用常见问题解答—ABI.doc

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1.????? 定量PCR仪的开关机顺序是怎样的? ????按照正确的开关机顺序操作,有助于延长仪器的使用寿命,减少仪器出故障的频率。开机顺序:先开电脑,待电脑完全启动后再开启定量PCR仪主机,等主机面板上的绿灯亮后即可打开定量PCR的收集软件,进行实验。关机顺序:确认实验已经结束后,首先关闭信号收集软件,然后关掉定量PCR仪主机的电源,最后关闭电脑。 2.????? 哪些种类的反应管和盖子适合定量PCR实验使用?有何需要注意的地方? ????定量PCR实验可以使用以下耗材:96孔光学反应板配合光学膜,0.2 ml光学八联反应管配合光学膜,0.2 ml光学八联反应管配合平盖的光学八联管盖。ABI公司生产的定量PCR耗材的具体使用方法和货号见下表: 3.????? 为什么要定期对电脑进行磁盘碎片整理?怎样整理? ????当运行实时定量PCR仪及使用软件分析实验结果时,计算机会删除并创建若干文件,计算机硬盘的空闲空间会被分割成越来越多的小块。当硬盘驱动器上文件以分解的碎片存储时,程序需要更长的时间才能存取文件,因为必须多次寻找文件碎片以存取不同的片断。碎片整理实用程序将一个文件分解开的多个碎片合并在一起,并存储到硬盘的同一个位置,从而清除文件碎片,进而优化系统性能。 碎片整理的方法如下: ????????? 在Windows桌面上,选择开始(start),我的电脑(My computer)。 ????????? 在(我的电脑)窗口中,用鼠标右键单击硬盘驱动器,并选择(属性)property。 ????????? 在(属性)对话框中选择工具(Tools)选项卡,单击开始整理(Defragment now)。 ????????? 单击碎片整理(Defragment)。 ????????? 当显示“碎片整理完毕”对话框时,单击(确定)。 ????????? 在“本地磁盘属性”对话框中,单击(确定)。 ????????? 为计算机机中剩余的驱动器重复如上步骤。 4.????? 何时执行windows service pack更新? ????不要执行该操作。除非美国应用生物系统公司代表通知您更新操作系统,否则请不要更新控制定量 PCR 仪的计算机的操作系统。新版本的 Microsoft Windows 操作系统有可能与SDS 软件存在冲突,并导致仪器不能正常运行。如果您希望安装 service pack(更新包)以更新操作系统,应查看随 SDS 软件提供的版本说明,避免兼容性问题。 5.????? 应该备份哪些数据? ????应该定期备份您的实验数据,备份频率推荐每周一次,用光盘刻录。同时您也应该备份定量PCR仪的各种纯荧光光谱校正文件、背景文件和安装验证实验数据,这些文件所在的目录是C:/Appliedbiosystems/SDS Document。下图是校正文件的样本。 6.????? 怎么样的实验室环境才能保证仪器设备正常运行? ????良好的实验室环境有助于延长仪器的使用寿命,减少仪器出故障的频率。推荐做到以下几个方面: ????电源:推荐配备合适的UPS或稳压器。 ????通风:仪器的通风应该没有阻挡。 ????温度:推荐实验室配备空调,温度应该控制在10-30°C之间。 ????湿度:20-80%;对于潮湿的省份,推荐实验室配备除湿机。 ????空间:易于操作,安全。 7.????? 怎样判断定量PCR仪的样本加热块是否被污染?怎样清除污染? ????一个办法是运行背景校正反应板,当一个或多个反应孔连续显示出不正常的高信号,则表明该孔可能被荧光污染物。另外一种办法是在不放任何物品到样本块上的前提下,执行ROI的校正,当某个孔的信号明显高出其他孔时,则表明该孔被污染。 ????清除样本加热块污染的步骤如下: ????用移液器吸取少量乙醇并滴入每个污染的反应孔中。 ????吹打数次。 ????将废液吸入废液杯中。 ????重复以上步骤:乙醇三次,去离子水三次。 ????确认反应孔中的残留液体蒸发完 8.????? 什么是背景校正?多长时间执行一次背景校正? ????背景校正程序测量定量PCR仪所使用的反应管和水的空白荧光强度。在运行校正程序期间,定量PCR仪在10分钟内连续读取背景校正板的荧光强度,信号收集的温度为60 °C。随后,SDS软件计算所收集到的荧光强度的平均值,提取结果并保存到校正文件中。软件在今后的分析中将自动调用此校正文件,从实验数据中扣除背景信号。 ????因为背景荧光的信号强度随着许多外界因素(比如外来的污染、反应板/反应管的生产厂商不同、水的纯度等)而变化,所以推荐定期进行背景校正,一般每三个月到半年校正一次。 9.????? 什么是纯荧光校正?多长时间校正一次? ????纯荧光校正是测定各种纯荧光染料标准品

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