地黄肌动蛋白基因片段的克隆与序列分析.pdfVIP

安徽农业科学 , Journal of Anhu i A gri. Sci. 2008, 36 (20) : 8470 - 847 1, 8474 责任编辑 　段永波 　责任校对 　马君叶 地黄肌动蛋白基因片段的克隆与序列分析 1 1 2 2 2 孙 鹏 , 郭玉海 , 祁建军 , 周莉丽 , 李先恩 　 ( 1. 中国农业大学农学与生物技术学院 ,北京 100094; 2. 中国医学科学院药用植物研究所 ,北京 100094) 摘要　[ 目的 ]克隆与分析地黄肌动蛋白基因片段 。[方法 ]根据与地黄相近物种肌动蛋白基因序列的保守区设计兼并引物 ,通过 RT PCR 方法扩增地黄编码区肌动蛋白基因。[结果 ]扩增片段全长为 724 bp ,对应编码 240个氨基酸 。序列比对分析发现其与其他高等植 物肌动蛋白基因核苷酸序列同源性在 80%以上 ,氨基酸序列在 90%以上 。[结论 ]系统进化分析表明,扩增到的地黄肌动蛋白基因与烟 草 actin7基因有较近的亲缘关系。 关键词　肌动蛋白;地黄 ;序列分析;系统进化分析 ( ) 中图分类号　S188　　文献标识码　A　　文章编号　0517 - 6611 2008 20 - 08470 - 02 C lon ing and Sequence Ana ly sis of A ctin Gene from R ehm ann ia g lu tin osa ( ) SUN Peng et a l　 College of A gronomy and B iotechnology, China A gricu ltural Un iversity, B eij ing 100094 Abstract　[Objective ] The aim of this study is to clone and analyze the actin gene from R ehm ann ia g lu tinosa. [M ethod ] D egenerate p rim ers were designed according to the con served region s of actin sequences of R ehm ann ia g lu tinosa and its sim ilar sp ecies, RTPCR was next conducted to amp lify the actin gene from R ehm ann ia g lu tinosa. [R esult ] The amp lified fragm ent is 724 bp and correspondingly 240 am ino acids. The BLA ST resu lts indicate that the homology between the amp lified fragm ent and other h igher p lants for actin gene sequences and am ino acid are more than 80% and 90% , resp ectively, suggesting that the amp lified fragm ent is the actin gene of R ehm ann ia g lu tinosa. [ Conclu sion ] Phylogenetic analysis show s that the actin gene of R ehm ann ia g lu tinosa has an intim ate genetic relation sh ip w ith actin7 gene of N icotiana tabacum