蛋白质四连子结构的扭角合成计算及其误差分析.pdf

摘 要 蛋白质空间结构的研究是蛋白质功能研究的必经之路，因为结构决定 功能。面对大量新发现的蛋白质，传统的用来测定蛋白质三维结构的实验 方法——-X光晶体衍射和NMR(核磁共振)技术己经无法跟上脚步，必须 发展计算的方法去预测蛋白质的空间结构。 本文以世界上广泛使用的生物分子三维结构数据库PDB为基础，利用 沈世镒教授提出的蛋白质主链的三角形拼接带模型，详细分析了蛋白质四 连子的空间结构。通过旋转变换等相关知识．给出了四连子旋转角合成的 计算方法，并对理论计算的西c角和实际空间结构中的西r角进行了误差分 析。误差分析的目的是为了让我们能够更加清楚、更加深刻的认识蛋白质 的空问结构，为以后的蛋白质结构预测打下基础。 关键词： 蛋白质结构分析，蛋白质主链的三角形拼接带，四连子， 旋转合成，误差分析 Abstract The thebase research researchofProtejnsh”dcturcjS ofthe ofProtein spatial the function．forstructure moleandmorenew determinesthefunction．As proteins havebeen traditional methods Protein found，the experimental ofmeasuringspatial as diffractionand Reso- structure．such NMR(Nuclear X—raycrystalloid Magnetic not the nance)，can with must keepup steps．We producing developcomputational to Protein withthe data． predict experimental method．．s structure，combining In this authorthe beltmodelof backbone， paper,the applytriangle protein’S of by Shen，to structure fouramino proposed spatial Prof．Shiyi analyze protein acid on山ewideUSed databasePDB．Theauthor residues，based 3D_sIxuctole give outthe met