自动化DiversiLab System DNA指纹分型系统在白假丝酵母同源性分析中的应用.pdfVIP

自动化DiversiLab System DNA指纹分型系统在白假丝酵母同源性分析中的应用.pdf

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548· JDiagnConceptsPract2011,Vo1.10,No.6 . 论 著 . 自动化 DiversiLabSystemDNA指纹分型系统 在 白假丝酵母同源性分析中的应用 刘锦燕 , 项明洁 , 倪培华 , 张 华 , 陈 华 , 倪语星 曲 (1.上海交通大学医学院附属瑞金医院卢湾分院放免检验科,上海 200020; 2a.检验系_b.微生物科,上海交通大学医学院附属瑞金医院,上海 200025) 摘【要1 目的:探讨 自动化DiversiLabSystemDNA指纹分型系统 (DiversiLab系统)在 白假丝酵母同源性分析中的 应用 ,并评价该系统的作用。方法 :应用标准化试剂盒进行 白假丝酵母的PCR扩增 ,在微流控芯片电泳和Agilent2100 生物分析仪上收集扩增产物,并用 DiversiLab系统分析软件进行 DNA指纹分析。结果:35株从重症加强治疗病房患者 中分离的白假丝酵母分为 7个型别,其中A型 l3株,B型8株,C型6株,D型 3株,E型2株,F型2株,G型 l株。2株 氟康唑耐药菌株属于B型,4株氟康唑剂量依赖敏感菌株为C型。结论:自动化DiversiLab系统有快速、简便、重复性和 分辨率高的特点.且具建立数据库并行不同实验室间数据比对的优势,可作为临床同源性分析鉴定和分型的一线工具。 关键词 :DiversiLab系统; 白假丝酵母 ; 重复序列聚合酶链反应 ; 同源性分析 中图分类号:R519 文献标识码 :A 文章编号 :1671-2870(2011)06.0548—05 Application ofautomatedDiversiLab System DNA fingerprinting in homologousanalysisofCandida albicans LIUJin—yon,XIANGMing-jie,NIPei—hu ZHANGHua,CHENHua ,M Yu— . .Radioimmunologyand ClinicalLaboratory,LuwanBranch,Ru~inHospita!,ShanghaiJiaotongUniversitySchoolofMedicine,Shanghai200020, China;2c~DepartmentofClinicalLbaoratory,2b.DepartmentofClinicalMicrobiologyLbaoratory,RuijinHospita!,Shanghai JiaotongUniversitySchoolofMedicine,Shanghai200025,China [Abstract] 0bjective ToapplyautomatedDiversiLabSystem DNAfingerprintinginhomologousanalysisof Candidaalbicno sandevaluateitsperformance.M ethods PCR amplificationwasperformedusingstandardizedreagent kits and its productwas detected by microfluidics—based electrophoresis and Agilent2100 Bioanalyzer.The DNA fingeprrintingdatawasinterpretedbyWeb-basedsofiware.Results Amongthe35strainsofCandidaalbicansisolated,7 typeswereclassified,includingAtype(13strains),Btype(8strains),Ctype(6strains),Dtype(3strains),Etype(2strains), F

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