土壤宏基因组学技术与应用.pdfVIP

维普资讯 应 用 生 态 学 报 2007年 1月 第 18卷 第 1期 ChineseJournalofAppliedEcology，Jan．2007，18(1)：212—218 土壤宏基因组学技术及其应用 木 沈菊培 张丽梅 郑袁 明 朱永官 贺纪正 “。 (中国科学院生态环境研究中心城市与区域生态国家重点实验室 ，北京 100085； 中国科学院研究生院，北京 100039) 摘 要 传统的基于培养的研究方法只能反映土壤中少数(0．1％ ～10％)微生物的信息，而 大部分微生物 目前还不能培养，因而这部分微生物资源 尚难 以被有效地开发利用．宏基因组 学是分子生物学技术应用于环境微生物生态学研究而形成的一个新概念，主要技术包括土壤 DNA的提取、文库的构建和 目标基因克隆的筛选．它可为揭示微生物生态功能及其分子基础 提供更全面的遗传信息，并已在微生物新功能基因筛选、活性物质开发和微生物多样性研究 等方面取得 了显著成果．本文对土壤宏基因组学技术的方法和应用作 了详细介绍． 关键词 宏基因组学 土壤 DNA提取 文库构建 文库筛选 应用 文章编号 1001—9332(2007)01—0212—07 中图分类号 S154．4 文献标识码 A Methodologyandapplicationofsoilmetagenomics．SHENJu—pei’‘，ZHANGLi—mei‘，ZHENG Yuan—ming ，ZHU Yong—guan ‘ ， HEJi—zheng(‘S‘tateKeyLaboratoryofUrbanandRegionalEcolo— gY，ResearchCenterforEco—EnvironmentalSciences，ChineseAcademyofSceinces，Beijing100085， China；GraduateUniversityofChineseAcademyofSceinces，Beijing100039，hCina)．一hCin． Ap— p1．Eco1．，2007，18(1)：212—218． Abstract：Culturablemicroorganismsprovideverylimitedinformationonsoilmicrobialdiversity， becauseonly0．1％ 一 10％ ofsoilmicroorganismsCna beculturedunderconventionallaboratory conditions．A novelculture—independentapproach，i．e．，metagenomicmethodology，hasbeende— velopedasaneffectivetoolforthediscovery ofnewnaturalprodtlctsandmicrobial functions．Soil metagenomicmethods，comprisingisolationofsQilDNAandconstructionandcsreeningofcloneli— braries，enabletopeepatmorecompletescenarioofsoilmicrobialcommunities，andthus，tobetter understnadtheirinteractions．Thismethodoloyg isofgreatpotentialofruseinthestudiesofosilmi— crobial communitiesandtheirfunctionalgeqes，na dinhtediscovery ofnew biocatalystsofrindustry