水稻导入系群体育性和粒型关联标记分析.pdfVIP

水稻导入系群体育性和粒型关联标记分析.pdf

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摘要 育性和粒型是水稻改良的两个重要的性状。本研究利用一套广亲和恢复系中 413为背景的多亲本导入系,即以全球130个水稻品种作为供体和“中413”作为受 体亲本,通过2—4次回交和2次以上自交纯合化的高代回交群体,以及由导入系 与三系不育系“玉A’和“川香29A”构建的测交群体,进行了育性与粒型相关基因的 分子标记关联分析。结果表明: 1、对育成的约2200个株系的导入系群体经目测选择长粒株系,测量粒长、粒 宽变幅为2.O一3.8mm,长宽比变幅为23—4.3,粒型变化明显。 2、参照康奈尔大学发布的分子标记连锁图,选出480个均匀分布于全基因组 的SSR标记和40个InDel标记用于群体检测和数量性状定位。显著性标记筛选工 作采用两个步骤完成。首先利用少量目标性状的极端株系进行全基因组分子标记扫 描,通过卡平方测验筛选显著性分子标记;接着对初步获得的相关标记,用更多表 型与轮回亲本有显著差异的株系进行验证,用卡平方测验筛选目标性状的关联标 记。 3、利用测交F1群体中不育和严重低育株系及高结实率株系,发现第l染色体 入片段置换了中413的恢复基因造成恢复性丧失或下降,也可能导入其他复等位基 因增强中413育性恢复能力。 4、通过粒重较轮回亲本显著增加株系分析,发现第3染色体RM347一RM520、 间有增加粒重的基因。通过粒型与中413显著差异导入系基因型分析,找到与粒型 关联的分子标记。 5、针对群体中高世代回交导入系的特点,设计不同比例的非对称混合样品池, 检测PCR扩增和电泳检测的效果,提出利用混合样初筛,再对阳性混合池进行单 株检测的二级标记分析策略,以提高非轮回亲本基因型的检出效率。 由于多供体亲本的导入系群体是一类新的定位群体,具有群体规模大、遗传结 构复杂、可以分析复等位基因遗传效应等特点,本文对多亲本导入系群体构建、标 记检测和数据分析方法,以及用于粒重粒型QTL定位的效果和混合池筛选等作了 初步分析讨论。 关键词:水稻导入系恢复基因粒型SSR标记InDel标记 Ill Abstract male dimensionaretwo traits Cytoplasmicsterility(CMS)andgrain of important rice as used130ricecultivarsthedonor andaCMSrestorcr improving.We parents 413”asthe ‘Zhong recurrent buildaset line parent∞),to ofmulti-parentintrogressive 2-4times than (Ⅱ0populationby ofbaekerossesandmore 2times ofselfing.Test hybrid were crossesbetweenCMSlines‘‘Yu populationsdevelopedbymaking A’i 29Aandthe lines.TheassociatedmarkersforCMS

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