HyperChem软件应用2011.pptVIP

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HyperChem 简介 HyperChem软件是HyperCube公司开发的Windows界面程序。是常用的分子设计和模拟软件。 应用: 1、构建复杂的分子模型 2、综合计算与分析? 1. HyperChem软件功能强大,组成模块: (1)构造分子; (2)优化分子结构; (3)研究分子反应; (4)观察轨道和电子图谱; (5)评估化学反应路径; (6)研究分子动力学。 2.建立与显示分子骨架模型: 结构输入和对分子操作。 除了能绘制分子的平面结构,还能够获得分子的空间构型、键长、键角、扭转角、氢键等参数。建立起3D或2D分子结构模型。 几何优化?? 3. 化学计算: 量子化学计算(从头计算,半经验方法,密度泛函计算):单点计算、几何优化和过渡态寻找计算; 分子力学计算; 分子动力学模拟计算(Langevin,Metropolis Monte Carlo模拟)。 ?4. 可以用来研究的分子特性: 同位素的相对稳定性;生成热;活化能;原子电荷;HOMO-LUMO能量间隔;电离势;电子亲和力;偶极矩;电子能级;过渡态结构和能量;非键相互作用能; 5.模拟分子光谱 分子光谱(振动光谱、电子光谱)是结构化学中非常重要的内容之一。 研究物质的分子光谱,可以使我们了解分子中电子的运动,分子中各原子核的相对振动以及整个分子的转动情况。分子光谱也是现代研究分子结构和进行定性、定量分析的重要方法之一。 HyperChem能够对分子进行振动分析,对振动频率、振动模式、红外吸收强度、电子跃迁等进行计算, 6. 数据库(Database) 氨基酸、核酸、糖类。 6. 其它模块:晶体构造器;糖类构造器,构像搜寻,QSAR特性,脚本编辑器。

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