第六章真核生物的遗传分析.ppt

本章学习要点 1、真核生物的基因组 2、真核生物基因组DNA序列的复杂度 3、DNA序列的类别 4、卫星DNA 5、基因家族、基因簇和假基因的含义 6、真核生物基因组的包装过程 7、真核生物基因的丢失、扩增和重排 8、遗传标记的类型和特点、应用 第一节 真核生物基因组 一、基因组与C值 基因组：一个物种单倍体的染色体的数目及其所携带的全部基因称为该物种的基因组 （genome）。 C值：一个物种单倍体基因组的DNA含量是相对恒定的，它通常称为该物种DNA的C值 。 不同物种之间C值相差极大。 二、真核生物基因组的结构特点 1．真核生物基因组大部分位于细胞核中，一般由多条染色体组成，每条染色体又是由DNA分子与蛋白质稳定地结合成染色质的多级结构 . 2．每条染色体的DNA分子具有多个复制起点，基因内存在着不表达的插入序列，即内含子。 3．存在大量不编码蛋白质的DNA序列，如果蝇的基因数估计约为5000个，占基因组DNA序列的10％左右，人的基因数推测为50000个，约占基因组DNA序列的1％。 4．真核生物的蛋白质编码基因往往位于基因组DNA单拷贝序列中，除单拷贝序列外还存在大量重复序列（repeat sequence），重复序列的拷贝数可高达百万份以上，在人的基因组中，至少具有20份拷贝的DNA可占总DNA的30％左右。 5．真核生物基因组中，有许多结构相似、功能相关的基因组成所谓的基因家族（gene families）。同一基因家族的成员可以紧密地排列在一起，成为一个基因簇。也可以分散在同一染色体的不同部位，或位于不同的染色体上。 6．真核生物除了主要的核基因组外，还有细胞器基因组，而且细胞器基因组对生命是必须的， 第二节 真核生物基因组DNA序列 的复杂度 一、重复序列的检测 通过复性动力学来检测基因组DNA序列的复杂性。 　也就是通过DNA的变性（denaturation）和复性（renaturation）反应的动力学过程分析DNA序列的性质。 公式： 单链消失速度 　从方程式可见控制复性反应的参数是C0t，如当t＝t1/2时，即 如果基因组中每一种基因只有一个，即都是单拷贝序列，那么基因组愈大则基因组的复杂性愈大，复性速率愈小，k也愈小，所以C0t1/2与非重复序列的基因组大小呈正比。即 二、DNA序列的类别 　 （一）单拷贝序列（unique sequence）亦称非重复序列（nonrepetitive sequence）在一个基因组中只有一个拷贝或2-3个拷贝。 （二）中度重复序列（moderately repetitive sequence）中度重复序列中的重复单位平均长度约300bp，重复次数为10～102。 （三）高度重复序列（highly repetitive sequence）顾名思义，高度重复序列就是在基因组中存在大量拷贝的序列，一般重复次数在106以上。通常这些序列的长度为6～200bp，如卫星DNA。 三、卫星DNA 卫星DNA(satellite DNA)是一类高度重复序列? 　　DNA在介质氯化铯中作密度梯度离心，离心速度可以高达每分钟几万转；此时DNA分子将按其大小分布在离心管内不同密度的氯化铯介质中，小的分子处于上层，大的分子处于下层；从离心管外看，不同层面的DNA形成了不同的条带。 根据荧光强度的分析，可以看到在一条主带以外还有一个或多个小的卫星带。这些在卫星带中的DNA即被称为卫星DNA，这种DNA的GC含量一般少于主带中的DNA，浮力密度也低。 卫星DNA按其浮力密度的大小可以分成I、Ⅱ、Ⅲ、Ⅳ四类，其浮力密度分别是1．687，1．693，1．697和1．700 g／cm3。各类卫星DNA都是由各种不同的重复序列家族所组成。卫星DNA通常是串联重复序列。 卫星DNA按其重复单元的核苷酸的多少，可以分为两类。一类是小卫星DNA(minisatellite DNA)，由几百个核苷酸对的单元重复组成。另一类是微卫星DNA(microsatellite DNA)，由2个到20个左右的核苷酸对的单元重复成百上千次所组成。 第三节 基因家族 一、基因家族的类型和Alu家族 　１、含义：真核生物的基因组中有许多来源相同、结构相似、功能相关的基因，这样的一组基因称为一个基因家族（gene family）。 ２、分布　可在分布在一条染色体上，也可以分布在不同染色体上。　 ３、分类 ①简单的多基因家族；②复杂的多基因家族；③不同场合表达的复杂多基因家族（图7-7）。 ４、常见的基因家族 5SrRNA基因家族 海胆和果蝇的5个组蛋白基因家族 ５、Alu家族（Alu family） 成员众多，大约平均每6kbDNA