鸡CAST基因cDNA克隆、组织表达及其生物信息学分析.pdf

中文摘要 钙蛋白酶系统在细胞内普遍存在，主要包括钙蛋白酶和钙蛋白酶抑制蛋白，其 参与机体生长与代谢过程，尤其在肌原纤维更新和宰后肉嫩化中扮演重要角色。钙蛋 抑制肌肉蛋白质降解；屠宰后可抑制钙蛋白酶的活性，降低蛋白质水解，从而影响肌 肉的生长和嫩度，因而CAST基因将极有希望成为研究畜禽肌肉生长和肉质性状的候 选基因。 以地方品种四川山地乌骨鸡为试验材料，克隆获得了鸡CAS瑾因的全编码区序 (XM 424713)比对，发现本试验所得序列与原鸡的一致性为99．9％。有两个碱基突 有造成氨基酸的突变。经生物信息学分析，鸡CAST是一个具有2个跨膜螺旋和5个疏 酸化位点。该蛋白质的二级结构含有alpha螺旋、延伸片断和随机螺旋三种结构，且 随机螺旋占多数。该蛋白与钙蛋白酶抑制蛋白具有结构和功能上高度相似性。 以地方品种四川山地乌骨鸡、藏鸡和培育优质鸡“大恒”S01系为试验材料，采用 SYBR I定量PCR分析C彳．盯基因在1日龄和84日龄两个时间点品种间的表达差 green 异，同时分析了四川山地乌骨鸡胚胎期(第9天和第15天)、1日龄和84日龄等4个时 间点CAST基因表达的组织差异，以及腿肌、胸肌、脑、心脏、肝脏、腹脂和皮脂组 织中CAST基因表达量的发育性交化。结果表明：CAST基因在鸡不同生长发育阶段 都有表达，并且在不同阶段各有优势表达组织，同一组织中也有表达的优势时间点。 CAST mRNA在整个发育阶段的心组织均有较高水平表达；肌肉组织在胚胎期表达量 较低，而在出生后表达量较高，为表达优势组织。四川山地乌骨鸡各组织中CAST mRNA表达水平存在明显的发育性变化：肌肉组织在第42天表达量达到最高点，随后 随着日龄增加表达量降低。C彳S硅1日龄藏鸡和lO周龄大恒优质鸡各组织中也有表 达，并且在肌肉组织中的高表达受品种的影响。 关键词：鸡，CAS瑾因，克隆，表达 cDNAClon and ing，TissueExpression TheChicken ic of Bioinformat Analysis Genes Calpastatin XIAO Geneticsand Breeding) Lian(Animal DirectedPro．ZHU by Qing ofAnimalScienceand (College Technology, Sichuan 14) AgrJIculturalUniversity,Ya’an，Sichuan，China，6250 Abstract The which molecules：two systemmainlycomprised C一十一d印endent calpain and athird in ubiquitous