双色荧光杂交芯片在近交系小鼠遗传监测中应用.pdfVIP

动 物 学 研 究 2008，Feb. 29(1) ：10－16 CN 53-1040/Q ISSN 0254-5853 Zoological Research 双色荧光杂交芯片在近交系小鼠遗传监测中的应用 1，* 1 2 1 1 1 崔淑芳 ，瞿秀华 ，韩士忠 , 余琛琳 , 孙 伟 , 汤 球 （1. 第二军医大学 训练部实验动物中心，上海 200433; 2. 复旦大学 生命科学院遗传研究所生物遗传工程重点实验室，上海 200433 ） 摘要：应用一种新的高通量 SNP 检测方法-双色荧光杂交芯片技术进行近交系小鼠遗传监测。应用双色荧光 杂交芯片技术对 4 个品系近交系小鼠的多个基因组 DNA 样本进行 SNP 分型，整合 6 个 SNP 位点的芯片杂交信 息，对样本所属品系进行判断。研究结果表明 SNP 检测方法-双色荧光杂交芯片技术能够对选定的 6 个 SNP 位点 进行高准确率分型；双色荧光杂交芯片技术是一种高通量 SNP 检测的良好工具，适合于对少量近交系品系来源的 大样本量小鼠进行遗传污染监测和品系鉴定，并具有扩大应用的潜力。 关键词：SNP；双色荧光杂交；小鼠 中图分类号：Q341 ；Q524 文献标识码：A 文章编号：0254-5853- （2008 ）01-0010-07 Application of Dual-color Fluorescence Hybridization Chip Technique in the Monitoring of the Genetic Quality of Inbred Mice Strains 1，* 1 2 1 1 1 CUI Shu-fang ，QU Xiu-hua ，HAN Shi-zhong ，YU Chen-lin ，SUN Wei ，TANG Qiu (1. Experiment Animal Center, Training Department, Second Military Medical University, Shanghai 200433, China; 2. State Key Lab of Genetic Engineering, Institute of Genetics, School of Life Science, Fudan University, Shanghai 200433, China) Abstract: This study aimed to use a microarray-based method for scoring a number of genomic DNA in parallel for one SNP marker on a glass slide for the genetic monitoring of inbred mice. We applied the method to identify inbred laboratory mice strains to validate the reliability and stability of this genotyping panel. The amplified PCR products from four inbred strains were spotted and immobilized onto amino-modified glass slides to generate a microarray, which was then interrogated by