Miningtissuespecificity,geneconnectivityanddisease：组织特异性基因的挖掘，连通性和疾病.docVIP

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2017-08-31 发布于重庆
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Miningtissuespecificity,geneconnectivityanddisease：组织特异性基因的挖掘，连通性和疾病.doc

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Mining tissue specificity, gene connectivity and disease association to reveal a set of genes that modify the action of disease causing genes Antonio Reverter, Aaron Ingham, Brian P. Dalrymple Computational and Systems Biology, CSIRO Livestock Industries, Queensland Bioscience Precinct, 306 Carmody Road, St. Lucia, Brisbane, Queensland 4067, Australia. Additional Table 2: Guilt-by-Association list: 112 genes not associated with disease according to OMIM yet with high connectivity with disease-associated genes Gene Alias Proportion of disease genes among connectors Polymorphism or differential expression associated with disease Reported in disease QTL ACAA2 DSAEC 0.851 No No ACVR2A ACTRII 0.923 Gastrointestinal cancer 45 No ADHFE1 FLJ32430 1.000 No No AKR1B10 ARL-1 0.812 No No AKR1D1 SRD5B1 0.928 Hepatitis 32 No AKT3 PKBG 0.794 No No APBA2BP XB51 0.870 No No APEX1 APE 0.842 Cancer 10 No BCDO2 0.823 No No BIRC2 cIAP1 0.846 Cancer 3 No CCNA2 0.916 Cancer 50 No CCR5 1.000 Protection against HIV infection 22 No CDT1 0.763 Cancer 26 No COBRA1 0.800 Cancer 39 No COPS5 JAB1 0.760 Cancer 13 No CXXC5 HSPC195 0.928 No No DARS 0.782 No No DTYMK 0.823 No No DVL2 0.805 No No E2F5 0.928 Cancer 47 No ENTPD4 LALP70 0.784 No No ESCO1 ESO1 0.756 No No FLJ40504 0.941 No No FRS2 SNT1 0.933 No No GADD45A 0.846 Cancer 54 No GGTL3 D20S101 0.869 No No GGTLA1 GGT-REL 0.869 No Developmental 14 GLI1 0.814 Cancer 9 No GMPPA 0.846 No No GMPPB 0.846 No No GNA12 0.869 No Cancer 23 GNA13 0.888 No No GNG12 0.857 No No GPX5 0.823 No No GTF2B 0.760 No Cancer 52 GTF2E1 0.764 No No GTPBP4 CRFG 0.772 Kidney Disease 31 No HNRPAB 0.937 No No HSD17B12 0.812 No No HTATIP TIP60 0.857 Cancer 18 No IDI2 0.791 No No IL10RB 0.900 Severity of organ rejection 36 Malaria susceptibility 28 IL22RA1 0.896 No No IL23A 0.906 Psoriasis 6 No ITGB5 0.961 Cancer 29 No ITGB8 1.000 No Spinocerebellar ataxia 11 KHDRBS1 SAM68 0.800 No No KNG1 0.9