鸡SCD和Sirt1基因SNP搜寻及其遗传多样性分析.pdfVIP

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畜牧兽医学报2008,39(3):278—285 ActaVe-terinariaetZootechnicaSinica 鸡SCD和Sirt1基因的SNP搜寻及 其遗传多样性分析 刘三凤,任军,郭源梅,杨艳,张志燕,黄路生’ (江西农业大学动物生物技术国家重点实验室培育基地,南昌330045) 摘 要:硬脂酰辅酶A去饱和酶(Stearoyl-CoA 代谢相关的功能基因。本研究以泰和丝毛乌骨鸡、杏花鸡、隐性白洛克鸡为研究材料,利用DNA池比较测序技术 对鸡SCD和S加l基因的整个编码区进行SNPs搜寻,共检测出鸡SCD基因SNPs13个,其中5个编码区SNPs (cSNPs),2个为错义突变,10个为新发现的SNPs;检测出鸡Sirtl基因SNPs35个,其中10个cSNPs,2个为错义 突变,18个为新发现的SNPs,另外有3处插入/缺失多态。对SCDC.492GA和Sirtlc.1753GA位点在隐性 白洛克鸡、杏花鸡、泰和丝毛乌骨鸡、白耳黄鸡、康乐鸡、南城黑鸡等271个个体中进行了PCR—SSCP检测,发现它 们具有丰富的多态性,为这个染色体区域进一步的关联性分析提供了新的标记。 关键词:鸡;SCD;Siftl;SNP;遗传多样性 中图分类号:$831.2 文献标识码:A 文章编号:0366—6964(2008)03—0278—08 Identificationof Nucleotide of Single Polymorphisms 姗andSirtlandEvaluationofTheirGeneticDiversities inChickens UU Jun,GUOYuan-mei,YANGYan,ZHANG San-feng,REN Zhi-yan,HUANGLu-sheng’ (CandidateNational of KeyLaboratoryfo,.Animal Biotechnology, JiangxiAgricultural 330045,China) University,Nanchang Sirtuin thechickenchromosome6are Abstract:Stearoyl—CoAdesaturase(SCD)and1(Sirtl)on twofunctionalthatare fat this associatedwith nucleotide genes deposition.Instudy,single poly— screened DNAofthreedi- morphisms(SNPs)werebycomparativesequenceanalysisusing pool chickenbreeds Taihe RecessiveRockand totalof13 Silk,White vergent including Xinghua.A SNPswereidenti

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