乳糖操纵子中的单分子随机动力学及其功能分析.pdfVIP

指 导 小组 成 员 导 师 : 冯 建 峰 教授 指 导小组 : 葛 颜 副教授 目 录 中文 摘 要 … … ，… … 英 文 摘 要 … … 第一 章 背 景 介 绍 … … 1.1 分 子 生物 学 的 中心 法 则 … … 1.2 基 因操 纵子 理 论 简介 … … 第 二 章 结 论 … … ，… … 4 4 2 .1 乳糖 操 纵子 的单分 子 随机模 型 … … 2.2 双 稳 现 象 … … 2 ，2 .1 正 反馈 机 制 会 引起 确 定 性 双稳 现 象 ，但 是 单 分 子状态 的涨 落 会 进 一 步 增 强 它 … … 5 2.2 .2 极其 缓 慢 的单 分 子状 态 随机 转 换会 诱 导产 生 随机 双 稳 现 象..… … 6 2.2.3 确 定性 的与 随机 性 的尖 端 突变 现 象… … 8 2 3 随机 临界值 、时 间尺 度 分 离 与 亚稳 态 .，… … lO 2.4 细 胞 不 同显 型之 间 的随机 转 换 … … l2 2 .5 关 于 D N A 成 环 … … l4 40︶CO奋︺拭0︵︶、、/1﹃﹃了勺‘O八 第 三 章 分 析 方 法 与理 论 推 导 材 料 … … Z4今勺﹃2x11111‘乙 3.1 模 型推 导 … … ，..… … ，… … 3.1.1 整 体平 均 意 义 下 的确 定性 模 型 … … ，.… … 3.1.2 复合 随机 模 型 … … 3.2 参 数 拟 合 … … 3.2 .1 单个 细 胞 中乳 糖 操 纵 子 的数量 与产 生 率/衰减 率 … … 3.2.2 乳糖 操 纵 子 随机 动 力 学参 数 分 析 … … 3.2.3 诱 导 物 的摄 取 率 … … 3 3 D oob 一Gi lel 印ie 数值 方 法 … … 参考 文献 … … 致 谢 … … .‘ … … 摘 要 近 二 十 年 来 ，现 代 单 分 子 观 测 技 术 突 飞 猛 进 ，科 学 家 已经 可 以通 过 跟 踪 细 胞 中单个 蛋 白质 分子 的动 力学行 为 ，进 而探 索 由单 分子 随机涨 落所 引起 的显 型转 换现 象 。本文 结合近 期关 于乳糖操 纵 子 的部分 实验 数据 ，提 出 了一个 随机 动 力学 模 型 。该 模 型可 以很 好 的重 现 单 分 子 实验 中所 观 测 到 的现 象 ，其 中最 为 典 型 的 是 在 一 定 的诱 导物 浓 度 下 ，确 定 性 正 反馈 机 制 与 随机 单 分 子 涨 落 的共 同作 用 可 以使 得 细 胞 内部透 性 酶浓 度 呈 现 双 峰 分 布 的现 象 。D N A 分 子和 抑 制 子 蛋 白的 随 机 结 合 与 解 离在 一 定条 件 下会 引起 这 种 双 峰 显 型 的相 互 转 换 ，同时这 种 随机 性 也 会 明显 的增 大细 胞 内部透