基于ITS序列和RAMS标记分析青枯雷尔氏菌遗传多样性.pdfVIP

农业生物技术学报 Journal ofAgriculturalBiotechnology 2008,16 (4): 694~700  ·研究论文 · 基于 ITS序列和 RAMS标记分析青枯雷尔 氏菌的遗传多样性 *  郑雪芳 ， 车建美 ， 林营志， 蓝江林 ， 刘 波 ** （福建省农业科学 院农业生物资源研究所 ， 福州 350003） ： ITS RAMS random amplifiedmicro­satellites ） 技术对福建省不 同地域和不 同寄主作物 摘要 应用 序列和 （ ， 随机扩增微卫星 的青枯雷尔 氏菌(  )进行遗传多样性研究。结果表 明 ， 供试 的 21 株青枯雷尔 氏菌 的 ITS 区序列有 3 种类 ， 这 3 ITS 1 2 ， 与参比菌株 GMI1000 ITS 1 2 型 种类型菌株的 序列只有 ～ 个碱基的差异 的 区序列或者相 同或者有 ～ 个碱基 的 差异。利用 RAMS技术进一步分析表 明， 供试 的青枯雷尔氏菌及参比菌株 GMI1000 的基因组 DNA 间存在丰富的多态性。聚 类结果显示 ， 供试菌株可聚为 3 个类群， 同一寄主作物的菌株聚在同一类群 中， 同一地理来源 的菌株聚在 同一亚类群 中， 说 明 青枯雷尔氏菌的遗传分化与寄主作物和地理来源都存在相关性， 与寄主作物 的关系更密切 。 ： ； 遗传多样性； ； 关键词 青枯雷尔氏菌 ITS序列分析 RAMS标记 中图分类号: S188  文献标识码: A  文章编号: 1006­1304(2008)04­0694­07  GeneticDiversityAnalysisof  Based  on ITS SequenceandRAMSMarker  ZHENGXue­fang,CHEJian­mei,LINYing­zhi,LAN Jiang­lin, LIUBo**  The genetic diversity among 21 strains of  from different climate zones and host crops were  analyzedby ITS sequence and RAMS(random amplifiedmicro­satellites) methods,respectively. ThreetypesofITSsequencewere  obtained, and there were only 1 2 bases or no diversity in ITS sequence compared to the standard strains GMI1000. The total  ～ genomicDNAwasthen examinedbythe sensitivetechniqueofRAMS.Theresultsrevealedthat an obviousdiversity oftheirgenomic  DNA existed. The cluster analysis based on the RAMS bands showed that the tested isolates could be divided into 3