从细胞色素b基因全序列探讨大额牛分子系统发生.pdfVIP

从细胞色素b基因全序列探讨大额牛分子系统发生.pdf

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HEREDITAS (Beijing) 2008 1 , 30(1): 65―70 ISSN 0253-9772 研究报告 DOI: 10.3724/SP.J.1005.2008.00065 b 1, 2 2 2 2 2 2 李世平 , 常洪 , 马国龙 , 陈宏宇 , 冀德君 , 耿荣庆 1. , 225009; 2. , 225009 摘要:大额牛是一种半野生半家养的珍稀牛种, 有关其起源和系统地位一直存在争议。通过PCR 扩增、测序等 步骤共获得了 11 头大额牛细胞色素b(Cyt b)基因全序列(1 140 bp) 。应用分析软件, 对大额牛 11 条Cyt b 序列进 行了分析, 并结合GenBank 中牛属动物6 个近缘种的同源序列, 以亚洲水牛(Bubalus bubalis)为外群, 分别采用 邻接法(NJ)和最大简约法(MP)构建了牛属动物分子系统发育树。序列分析结果表明, 11 条大额牛 Cyt b 序列 1 140 位点中, 共发现95 个变异位点( 占分析位点总数的8.33 %), 定义了6 种单倍型, 表明大额牛群体的 Cyt b 基因遗传多态性比较丰富。构建的NJ 和MP 分子系统树均显示, 大额牛研究群体明显分为3 支, 第1 支与普通 牛(Bos taurus)相聚, 第2 支与瘤牛(Bos indicus)相聚, 第3 支与印度野牛(Bos gaurus)相聚。系统发育分析表明, 大额牛很可能是印度野牛的家养型或驯化种, 我国大额牛群体可能曾受到其他牛种血缘的入侵。 关键词:大额牛; 细胞色素b 基因; 起源; 分子系统发生 Molecular phylogeny of the gayal inferred from the analysis of cytochrome b gene entire sequences 1, 2 2 2 2 2 LI Shi-Ping , CHANG Hong , MA Guo-Long , CHEN Hong-Yu , JI De-Jun , GENG Rong-Qing2 1. College of Bioscience and Biotechnology, Yangzhou University, Yangzhou 225009, China; 2. College of Animal Science and Technology, Yangzhou University, Yangzhou 225009, China Abstract: The gayal (Bos frontalis) is a very rare, semi-wild and semi-domestic bovine species. There still exist remarkable divergences on the gayal’s origin and phylogenetic status. The cytochrome b (Cyt b) gene entire sequences (1 140 bp) of 11 gayals were sequenced and analyzed. Combined with other bovine Cyt b entire sequences cited in GenBank , the ph

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