烟草钾离子通道基因NKT5克隆和序列分析.pdfVIP

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2017-08-30 发布于安徽
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烟草钾离子通道基因NKT5克隆和序列分析.pdf

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8 中国烟草科学 ChineseTobaccoScience 2010-O8，31(4) 烟草钾离子通道基因NKT5的克隆和序列分析司丛丛 1,2 刘贯山1，刘好宝，焦蓉1,2 王树林 1,2 曲平治3 刘朝科，胡晓明，冯祥国 (1．农业部烟草类作物质量控制重点开放实验室，中国农业科学院烟草研究所，青岛 266101；2 ．中国农业科学院研究生院， jE京 100081；3．川渝中烟工业公司，成都 610000) 摘要：本研究运用已经获得的1条490bp的普通烟草钾离子 (I(+)通道基因的中间片段来设计特异性弓I物，应用RACE 方法获得其 3和5末端 cDNA序列。通过三段cDNA序列拼接结合全长克隆测序验证，获得一个未报道的普通烟草K+通道基因，并将其命名为NKT5(NCBI登录号为HM010922)。NKT5的eDNA全长为2365bp，其中5，端非编码区190bp、 3端非编码区249bp、编码区1926bp，编码641AA。对该基因进行了序列分析及功能预测，为进一步阐明其在烟草吸钾及抗逆过程中的功能及分子机制奠定了基础。关键词：烟草；I(+通道基因；AR CE；克隆；序列分析中图分类号：TS413 文章编号：1007—5119(2010)04—0008．06 DOI：10．39690．issn．1007．5119．2010．04．002 CloningandSequenceAnalysisofPotassium IonChannelGeneNKT5in NicotianaTabacum SICongcong ，LIU Guanshan，LIU Haobao ，JIAO Rong，一， WANGShulin ，QUPingzhi，LIUChaoke，HUXiaoming，FENGXiangguo。 (1．KeyLaboratoryofTobaccoQu~ityControl，MinistryofAgriculture，TobaccoResearchInstitute，ChineseAcademyof AgriculturalSciences，Qingdao266101，China；2．GraduateSchool，ChineseAcademyofAgriculturalSciences，Beijing100081， China；3．ChinaTobaccoChuanyuIndusrtialCorporation，Chengdu610000，China) Abstract：Basedona490bpmiddlesegmentofK ionchannelgene，apairofspecificprimerswasdesignde toacqu~e5’nad 3-endsofeDNA byAR CEsrtategy．AnunreportedK ionchnanelgeneintobacco (Nicotianatabacum)namde asNKT5was obtainedbysplicingthreecDNAsequencesna dsequencingfull—lengthcloning．Thefull-lengthcDNA ofNKT5is2365bplongwiht 190bp5-untranslatedregion(UTR)，249bp3’一UTRnad1926bpcodingsequence．Thededucde anlinoacidis641AAlong．The genesequencenaalysisna dfunctionpredictionwerecardedoutinordertoclarifymolecularmechanismsofpotassium absoprtion na dstress．resistna ceinhtetobacco． Keywort|s：tobacco；Kionchannelgene；AR CE；clone；sequence