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9 2 Vol. 9 No. 2
第 卷 第 期 生物信息学
2 0 1 1 6 China Journal of Bioinformatics Jun. ,20 11
年 月
doi :10. 3969 /j . issn. 1672 - 5565 . 20 11. 02 . 007
高粱抗坏血酸过氧化物酶基因的电子克隆及序列分析
1 2 1 1 1*
, , , ,
陈国强 孟 鹏 刘李黎 陈 刚 王 萍
(1. , , 222005 ;2 . , 110 161)
淮海工学院海洋学院 江苏省海洋生物技术重点实验室 江苏连云港 沈阳农业大学农学院 沈阳
: EST APX , 753bp , 250 ,
摘 要 利用高粱 数据库及电子克隆等技术克隆了高粱 基因 其开放阅读框大小为 编码 个氨基酸残基
27 . 1kDa , 5 . 135 。 C4 APX (ACG4 1151) ,
推导的蛋白质分子量为 等电点约为 它与 植物玉米的胞质 在进化上的距离最短 亲缘
。 APX , , 。 33 - 44 ,
关系最近 高粱 无信号肽 是亲水性蛋白 推测它定位于细胞质中 第 氨基酸片段为其过氧化物酶活性区域 第
155 - 165 。 APX
氨基酸片段则是其与亚铁血红素配基结合的区域 预测的二级结构及三级结构都表明高粱 含有较多的不规
, 。
则卷曲和α 螺旋 三级结构上呈椭球体
: ;APX ; ;
关键词 高粱 基因 电子克隆 序列分析
中图分类号:Q518. 2 文献标识码:A 文章编号:1672 - 5565 (2011)- 02 - 125 - 06
In Silico Cloning and Characterization of Sorghum APX Gene
CHEN Guo-qiang1 ,MENG Peng2 ,LIU Li-li1 ,CHEN Gang1 ,WANG Ping1
(1. Marine Science College ,Jiangsu Key Laboratory of Marine Biotechnology ,Huaihai Institute of Technology ,Lianyugang ,Jiangsu 222005 ,China ;
2. Agricultural College ,Shenyan
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