拟南芥ICEr2元件反式作用因子基因克隆与分析.pdfVIP

拟南芥ICEr2元件反式作用因子基因克隆与分析.pdf

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拟南芥ICEr2 元件反式作用因子基因的克隆与分析1 王琪,朱延明,王冬冬 东北农业大学生命科学学院,哈尔滨(150030 ) E-mail :wangqi198169@163.com 摘 要:低温、干旱、土壤盐渍化等非生物逆境环境会导致植物失水,严重时可造成细胞膨 压完全丧失,直至死亡。本研究以模式植物拟南芥为试验材料,以与抗逆密切相关基因CBF2 的启动子上游特定顺式元件ICEr2 作为“诱饵” ,利用酵母单杂交系统,克隆与其特异结合的 新转录因子基因-AtbZIP1 (At5g49450 );经结合特异性试验表明,AtbZIP1 基因在酵母体 内和体外能够与ICEr2 元件特异结合,并能够激活下游报告基因HIS3 的表达;利用Real-time PCR 方法和拟南芥渗透胁迫芯片杂交数据库的结果共同分析其表达特性,发现AtbZIP1 基因 可以在拟南芥的根和茎中表达,而且盐分可以诱导它在根中的高量表达。本研究对阐明转录 因子基因在植物渗透胁迫信号转导中的调控作用、抗渗透胁迫功能基因的调控表达以及渗透 胁迫相关应答机制奠定了重要理论基础。 关键词:ICEr2;AtbZIP1;拟南芥;转录因子 中图分类号:Q7 1. 引言 伴随基因组学研究的蓬勃发展,在 GeneBank 中登录的基因数目急剧增加, 当前重视 这一发展趋势,并充分利用网上资源,将使筛选新基因及鉴定基因功能的工作更方便快捷。 目前这方面的研究很多集中在对转录因子基因的克隆与功能鉴定上。真核生物中各种转录因 子在转录水平的调控是基因表达调控的重要方式之一。 转录因子一般都含有 DNA 结合区 与转录调控区, 通过与特异性的 DNA 元件的相互作用来调控生物体内相关靶基因在特定 条件(如环境胁迫)、特定组织中定时定量地表达。因此,要阐明细胞内各种信号转导与调 控基因表达的机制, 鉴定各种调控基因表达的 DNA 元件和转录因子至关重要。 干旱,高盐及低温是影响植物生长发育和农作物产量的限制因素。当植物受到这些非生 物逆境胁迫时,植物本身会发生一系列的生理生化变化,引发特异性胞内信号通路的激活或 抑制,以对逆境刺激做出相应的反应。属于 AP2 家族的 CBF/DREB(C-repeat binding factor/dehydrate responsive element binding factor)途径已被证实是赋予植物低温抗性的主效 途径,因而使其成为低温抗性领域研究的热点之一。作为冷应答反应主效途径的 CBF/DREB 信号通路属于非 ABA 依赖,拟南芥中存在大量启动子内具 DNA 顺式元件 CRT(C-repeat)/DRE(dehydration response element )[1] 的冷响应基因 (cold responsive, COR) , CRT/DRE 以CCGAC 为核心保守识别区。反式作用因子 CBF/DREB 在低温及脱水胁迫条 件下与该元件特异作用,从而激活下游 COR 基因的转录表达。COR 基因在低温条件下 的特异表达对植物的逆境生存具有十分重要的意义,其编码产物既可能是对细胞起保护作用 的蛋白质产物,也可能是次级转录因子,调控其他功能基因的特异表达。CBF/DREB 转录 因子家族分为干旱及高 盐 诱 导 的 DREB2 小 家 族 和 冷 诱 导 的 CBF/DREB1 小家 族。 后者由 CBF1/DREB1B,CBF2/DREB1C,CBF3/DREB1A,CBF4/DREB1D,DREB1E , DREB1F 组成,其中 CBF4/DREB1D 是渗透胁迫诱导的,而位于第 4 号染色体上 8.7kb 区 域内成簇排列的 CBF1、2 、3 是该领域的研究热点[1]-[3],三个 CBF 基因均为单外显子结构, 1本课题得到国家自然科学基金资助项目(3057099

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