中国李pgip启动子克隆及调控元件分析.pdfVIP

园　艺 　学 　报 　2009 , 36 ( 10) : 1425 - 1430 A cta Horticu lturae Sin ica 中国李 pg ip 启动子的克隆及调控元件分析 李广平1 , 张长青3 , 章 　镇2 , 曹福亮1 (1 南京林业大学森林资源与环境学院 , 南京 2 10037; 2 南京农业大学园艺学院 , 南京 2 10095; 3 金陵科技学院园艺 系 , 南京 2 10038) 摘 　要 : 在已克隆中国李 pg ip 序列的基础上 , 通过染色体步行法获得了该基因上游 1 869 bp 的启动子 序列 , 联合生物信息学中的进化印记法和启动子扫描法对克隆的启动子序列进行了调控元件识别 。结果报 道了 3个调控元件 : 1个 TGA 1结合位点 ( TGACG) 和 2个 W RKY结合位点 ( TGAC) 。这为全面揭示 pg ip 表达的转录调控机制提供了遗传基础 。 关键词 : 中国李 ; pg ip 启动子 ; 克隆; 调控元件分析 中图分类号 : S 6623　　文献标识码 : A 　　文章编号 : 0513353X (2009) C lon ing of pg ip Prom oter from P ru n u s sa lic in a and the Com puta tiona l Iden ti f ica tion of Its Regula tory E lem en t 1 3 2 1 L I Guangp ing , ZHAN G Changqing , ZHAN G Zhen , and CAO Fuliang (1 Colleg e of F ores t R esou rces and Environm en t, N anj ing F ores try Un ivers ity, N anj ing 2 10037, Ch ina; 2 Colleg e of H orticu ltu re, 3 N anj ing A g ricu ltu ra l Un ivers ity, N anj ing 2 10095, Ch ina; D ep a rtm en t of H orticu ltu re, J in ling Ins titu te of Technology, N anj ing 2 10038, Ch ina) A b stract: B a sed on the gene sequence of pg ip , we have ob tained an up stream fragm en t of 1 869 bp length by genom e walker from P runus sa licina. U sing the b io inform atic s m ethod s, including the p hylogenetic footp rin ting and the p romoter scann ing, we iden tified three cisregu latory elem en ts from pg ip p romoter. One is the TGA 1 site and the others are W RKY site s. Ou r discoverie s w ill be help to understand the tran scrip tional regu latory m echan ism on pg ip exp re ssion. Key words: P runus sa licina; p romoter of