Rho激酶抑制剂三维定量构效关系研究.doc

上海应用技术学院 毕业设计(论文) 题 目：Rho激酶抑制剂三维定量构效关系的研究 专 业： 应用化学 班 级： XXXXXXX 学生姓名： XXX 学生学号： XXXXXX 指导教师： XXXX 化学与环境工程学院 2013年6月 3日 上海应用技术学院毕业设计（论文）任务书 ? 题目：Rho激酶抑制剂三维定量构效关系的研究 学生姓名：XX 学号：XXXXXXX 专业：应用化学 任务起至日期：??2013????? 年???1? 月????1? 日至??????2013? 年???6? 月??18?? 日? 共??18??? 周 一、课题的任务内容： 本论文将采用3D-QSAR法，在SYBYL-X 2.0的水平下，以部分分子结构和生物活性（pIC50值）已知的Rho激酶抑制剂分子为训练集, 选用此系列分子的理化描述子, 包括分子的形状, 静电作用能和范德华作用能以及疏水描述子, 用三维定量构效关系(3D-QSAR) 方法建立反映分子结构与生物活性之间的定量构效关系模型。并基于此模型来设计新的Rho激酶抑制剂分子和进行结构修饰。 二、原始条件及数据： ? 原始资料来自于文献和指导教师提供的资料 三、设计的技术要求（论文的研究要求）： ? 建立具有显著统计学意义，预测能力良好的3D-QSAR模型 四、毕业设计（论文）应完成的具体工作： ? 1．分子结构的搭建 2．分子叠合 3.COMFA、COMSIA 回归分析（3D-QSAR模型的建立） 4. COMFA、COMSIA模型结果分析 5.新型活性分子设计及活性预测 ? 软硬件名称、内容及主要的技术指标（可按以下类型选择）： 计算机软件 SYBYL-X 2.0?? 结 构 模 型 ?√ ? 五、查阅文献要求及主要的参考文献： ?????????? ?要求：查阅中文文献10篇，外文文献5篇以上 主要参考文献： 1. Ramasamy Thilagavathi, Raj Kumar, Vema Aparna, M. Elizabeth Sobhia, Bulusu Gopalakrishnan and Asit K. Chakraborti. “Three-dimensional quantitative structure (3-D QSAR) activity relationship studies on imidazolyl and N-pyrrolyl heptenoates as 3-hydroxy-3-methylglutaryl-CoA reductase (HMGR) inhibitors by comparative molecular similarity indices analysis (CoMSIA)” Bioorganic Medicinal Chemistry Letters, 2005, 15:1027–1032 2. Assia Kovatcheva, Gerhard Buchbauer et al. QSAR Modeling of r-Campholenic Derivatives with Sandalwood Odor J. Chem. Inf. Comput. Sci. 2003, 43, 259-266 ? 六、进度安排：（设计或论文各阶段的要求，时间安排）： 求计算机应用能力和英语阅读能力较强 工作计划：要求完成下列内容： 1．分子结构的搭建； 2．分子结构的优化； 3．分子的叠合；4．3D-QSAR模型的建立；5.模型的有效性检验、新型活性分子设计及结构修饰。 工作计划： 第1周 — 第3周 查阅文献和收集资料。 第4周 — 第13周 分子结构的搭建、优化、模型的建立与验证 第14周 — 第15周 新型活性分子设计及结构修饰 第16周 — 第18周 撰写论文，准备答辩。 ? 指导教师： XXX?????????????????? ? ? 审核意见： ? ? 教研室主任： ? Rho激酶抑制剂三维定量构效关系的研究 摘要：运用比较分子力场分析方法（CoMFA）和比较分子相似性指数分析法（CoMSIA）对Rho激酶抑制剂化合物的结构参数和pIC50值进行分析，以58个分子结构和pIC50值已知的Rho激酶抑制剂化合物为训练集, 用三维定量构效关系3D-QSAR）方法建立了预测模型采用抽一法(leave one outLOO) 检验了预测模型的可信性接着用一个由5个Rho激酶抑制剂化合物组成的测试集进一步验证预测模型的预测能力用交叉验证系数q2和相关系数R2的值来证实3D-QSAR