猪轮状病毒GD1株VP7基因的克隆及序列分析.pdfVIP

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猪轮状病毒GD1株VP7基因的克隆及序列分析.pdf

广东畜牧兽 医科技 2010年(第35卷箜 塑 试验研究 ·29· 猪轮状病毒 GD1株VP7基因的克隆及序列分析 田小艳,孙 华,邓雨修,苏润环,王东东,宋延华 (广东省温氏集团研究院,广东 新兴 52740@ 摘 要:参考GenBank中发表的PRVOSU毒株VP7基因核苷酸序列ORF两端保守区序列,设计 1对特异 引物,以PRVGD1株反转录cDNA为模板,通过PCR方法扩增出长约 1kb的基因片段,并克隆到pMDI8-T 载体中进行序列测定。测序结果表明:VP7基因全长 1062bp,含有一个981bp的开放阅读框,编码 326 个氨基酸。与国内外已知的13个毒株VP7全长基因的核苷酸及推导的氨基酸序列比较,相似性分别为77. 4%一100%和 78.6%~99.7%;核苷酸系统发育进化树结果表明,GDI毒株与轮状病毒A2,JP3-6毒株亲缘关 系较近,为一个进化群 。 关键词:猪轮状病毒;VP7基因;克隆;序列分析 中图分类号 :$852.651 文献标识码 :A 文章编号 :1005—8567(2010)O1—0029~03 CloneandsequenceanalysisofVP7geneofporcinerotavirusstrainGD1 TianXiaoyan,SunHua,DengYuxiu,SuRunhuan,W angDongdong,SongYanhua (GunagdongWin’SGroupAcademy,Xinxing527400,China) Ab~raet: A pairofprimerstargetedtheconservedregion flankingtheORF ofVP7geneofporcine rotavims(PRV)strainOSU weredesignedaccordingtothepublishedsequences.ThePCR productof approximately lkb longwasamplified from CDNA ofPRV strain GD1.ThePCR productwascloned into pMD18-Tvectornadsequenced.nlefull-lengthofVP7genewas1062bplongincludingacodingregionof 98lbp,whichencodedaproteinwith326aminoacids.TheVP7geneofthePRV strani GD1shared77.4% to lO0% necleotidehomologyWi也 thatofohter13PRV srtains.TheaminoacidsofVP7geneofhtePRV strain GD1shared78.6%to99.7% amnioacidshomoloyg wim thatofother13PRV stranis.Theresultsshowedthat thestrainGDlwasmoreclosetostrainsA2andJP3.6. Key :Porcinerotaviru(PRV);VP7gene;clone;sequenceanalysis 轮状病毒 (Rotaviru,RV)是呼肠孤病毒科 毒外壳的光滑部分;VP7是~种N一联低聚甘露糖 (Reoviridae)轮状病毒属 (Rotavirus)的成员,是 糖蛋 白,VP7是PRV的外衣壳蛋 白,也是一种糖基 各种幼龄动物病毒性腹泻的主要病原之一[1]。猪 化蛋白,由326个 aa组成,因不同毒株而异,分别 轮状病毒病是一种人畜共患病,在猪群 中感染率 由7或 8,9基因编码,为病毒外膜主要中和抗原, 很高,仔猪被 RV感染后,机体免疫力急剧下降,从 决定病毒 的血清型,与病毒 的毒力及免疫保护性

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