面向药物发现组合化学衍生数据库系统设计.pdf

中文摘要 人类经避多年豹积累，从已知的蕊予多万争}化合物中牧集了大擞功能分子鲍 信惑，包括合成、结构、淫溪等等。如傅从这痤信崽大由中挖箍出裔瘸豹零露是 我{}j追馁霭要解决麴润题。薅落计冀飒敬硬传农网终技术酌不颧发展，我镌可以 构建一个西囱药物发现的缀合衍生数据库系统，从丽能够臻统一豹形式对现有化 学臻惑进行表达雾曩管理、§￡够对已鸯数据避纾快速粒硷索、并戆运瘸组台化学匏 思戆对所套询到的数据进行缀合以生成一系列的分予用于虑拟筛选，从而加快掰 药发臻静多饯。 ， 本论文枣要包括楣互密切关联豹两部分工作：一是开发了一套网于操{乍分子 拓矜缝稳的分子较{譬开发氢(NKMOLSDK)：二是建立了一个黑予辅瓒翡物发 现豹组合化学分子锈生程痒。 分子软件开发稳逶论文静萋硝开发项妥，主要包括纯学对象模块、数据疼模 块、埝天稔出模块、专f冀法模块取癍翅摸块。它戳强论为基硝，提供各鬟溺数 功能，翔：读写文传或数据痒中酌分子和反应数掇：操{乍鞭子、化学键、富能 嚣、分子、纯学爱瘫；谖捌分子蠡鼋纯攀结稳信息戳及对努予等进行壤盍霾嚣酝、组 台、据分等。剥用遮套工凝，可以对有机分予、有枫反应等进行有效的计算机处 理，双孺安瑷诸如分子识鄹、分子菠配、分子查询等功能，选能够摄摆用户璇的 要求对分子及结构拷断进行组合街生，形成数曩巨大黥分予籀羚缓构。 组合纯攀分子衍生程序通过对露户提交的磊椿纯会勃通式进行取代衍曩芝，爝 器耪不嚣熬取我摹罄羧遥焱中麴R基霞，钛}嚣组合生戒数嚣巨大豹以曩撅亿合 物为核心的组合化学分子瘁。用户提交的嚣标纯台物不同，租应生成鲍瘁也=：{i 冠。魏终，这个稳窍还与蠢辍纯学逶式反瘦数据痒耨连接，为嚣稼纯含物糖毛逵可 能豹台威反应参考。组台化学分子辑生程侉既可按桌面程序方式运行，瞧可按网 终鼹务程窿方式运行。 分子软件开发包和组合化学分子衍生程序主要采用C语言开发，在网络界 面方面采用PHP语言开发。 总的来说，本论文提供了一个用于新药发现的有利平台，为研究人员丌展工 作提供了方便，同时它也是我们以后工作的基础。 关键词：药物发现；组合化学；子结构匹配：数据库；化学信息学 II Abstract Chemistshave morethan20millionskindsof theamount known compounds．But ofthese istoo tobe withthe compoundsbig easily ofinformation Call to infomaticsdatabasesbebuilt development technology．chemical and storeadministrateallthis knowledge． Asoftware kit asetofdatastructuresand developmentfSDK)is functionsfor and a of thechemical as expressing processinggroupspecificobjects．For objects．such atoms。bondsand molecules．evenrea娃ions．onthebasisofformerworks，f