蛋白质组学复习总结.docVIP

蛋白质一级结构：指多肽链中氨基酸的排列顺序。主要靠肽键维系，有些蛋白质还包括二硫键。（Assembly组装，集合linear；ordered；1 dimensional；sequence of amino acid polymer； ⑤by convention, written from amino end to carboxyl end；⑥a perfectly linear amino acid polymer is neither functional nor energetically favorable—folding；⑦occurs at the ribosome ；involves dehydration synthesis and polymerization of。 Dihedral angle ±180o双面角Φ (phi) angle = rotation about Cα2—N1 ； ψ (psi) angle = rotation about Cα2—C2 蛋白质二级结构：指肽链主链的空间走向（折叠和盘绕方式），是有规则重复的构象。并不涉及氨基酸残基侧链的构象。主要的化学键：氢键（Folding折叠加工） 蛋白质二级结构的主要形式：(-螺旋 ； (-折叠；(-转角；无规则卷曲 ；环； 三股螺旋。 ①non-linear；②3 dimensional；③localized to regions of an amino acid chain； ④formed and stabilized by hydrogen bonding and other bonds 结构域（domain） 结构域是介于二级和三级结构之间的一种结构层次 蛋白质三级结构：指在一条多肽链中所有原子的整体空间排布，在二级结构的基础上进一步盘曲折叠形成的特定球状结构，包括所有主链和侧链的结构。（Packing包装） 次级键；二硫键（共价键）；疏水键；范德华力；离子键；氢键 ①non-linear；②3 dimensional；③global but restricted to the amino acid polymer； ④formed and stabilized by hydrogen bonding, covalent bonding, hydrophobic； ⑤packing toward core and hydrophilic exposure to solvent；⑥A globular amino acid polymer folded and compacted is somewhat functional and energetically favorable--interaction! 蛋白质四级结构：具有二条或二条以上独立三级结构的多肽链通过次级键相互组合而形成的空间结构（Interaction相互作用） non-linear；②3 dimensional；③global, and across distinct amino acid polymers； ④formed by hydrogen bonding, hydrophobic packing and hydrophilic exposure； ⑤favorable, functional structures occur frequently 结构与功能关系：一级结构决定其高级结构，高级结构决定其功能。 蛋白质一级结构是空间结构和生物功能的基础，一级结构决定空间结构； 镰刀形红细胞贫血（sickle-cell anemia） 编码珠蛋白β链的结构基因第六个密码子（codon）由CTT→CAT，相应的多肽序列中N端的第六个氨基酸由Glu→Vla；其空间结构发生相应改变，在表面形成互补区，使蛋白质分子之间彼此聚合，促使红细胞在低氧压下变形成镰形，使红细胞容易破裂，发生溶血，丧失运输氧的生物活性。 ①发夹式β模体：两段相邻的反平行β链被一环链连接在一起构成的组合，其形貌与发夹相似，故称为发夹式β模体（hairpin β motif），也称为β β组合单位（ β-β unit)。 ②反平行β层回纹模体： 4段反平行β链常常以特定的来回往复方式组合，其形貌类似于希腊钥匙上特有的回形装饰纹，故在文献中被称为希腊钥匙型模体（Greek key motif）。 ③β -α- β 模体：这是一种连接两股平行β 链的结构元素组合。几乎在所有含平行β 链的结构中都有该模体存在。 ④复杂模体：两个相邻的β发夹模体通过环链相连，可以构成更加复杂的模体。 血红素结构（Heme）：Hb中每个亚基包含一个血红素， 血红素：1个亚铁离子(Ferr