第四章 电泳图谱的图像分析及细胞蛋白谱的建立.pptVIP

蛋白质组学 主讲教师：张玲 2007.10.11 回顾 PDQuest 软件简介 PDQuest软件是显示（imaging）、分析（analyzing）双向电泳图谱＆数据库查询的一个软件包 硬件：一定的电脑配置,Pentirm 166处理器，64M内存，3G硬盘，1024*768分辨率 ，256色，SCI接口，windows操作系统 软件： PDQuest双向凝胶图像分析软件，Bio-Rad Laboratory,Hercules,CA PDQuest 软件的使用 凝胶的图像处理分析及细胞蛋白谱的建立 典型流程 凝胶图像的扫描： 图像加工： 斑点检测和定量： 凝胶配比： 数据分析： 数据呈递（report） 2-DE数据库的建立： PDQuest 软件 一、 图象采集与加工(editing images) 用工具栏的crop可以切割掉凝胶边缘没有蛋白质点的部分，以减少分析的复杂性，但要注意对你要分析的多块凝胶图像最好是切割成同样大小。（在操作时先选择其中的一个凝胶图象并选定要切割的区域，然后在imageadvance cropsave crop settings下保存crop的设定条件并输入保存的名称，其他的图象切割时在imageadvance cropload crop settings中选定先前保存的名称即可 ） 二 、斑点检测(spots detection