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生命活动的主要承担者──蛋白质
1.蛋白质的水解
研究蛋白质的水解作用可以为研究蛋白质的组成和结构提供有价值的资料。根据蛋白质的水解程度,可以分为完全水解和部分水解两种。完全水解(或称彻底水解),得到的水解产物是各种氨基酸的混合物;部分水解(或称不完全水解),得到的产物是各种大小不等的肽段和氨基酸。蛋白质可以被酸、碱或蛋白酶催化水解。
酸水解:常用硫酸或盐酸,使用最广泛的是盐酸。酸水解的优点是:不引起氨基酸的消旋作用(得到的是L氨基酸,不产生D-氨基酸)。缺点是:色氨酸全部被酸破坏,丝氨酸、苏氨酸和酪氨酸等也有一小部分被分解。由于甲基磺酸具有许多优点,目前,常用它代替盐酸来水解。
碱水解:常用氢氧化钠。碱水解的缺点是:水解过程中多数氨基酸会遭到不同程度的破坏,并且产生消旋现象(所得产物是D-氨基酸和L氨基酸的混合物)。优点是:在碱性条件下色氨酸稳定,能定量回收。
酶水解:酶水解获得的是蛋白质的部分水解产物,主要用于蛋白质一级结构分析。常用的蛋白酶有胰蛋白酶、糜蛋白酶和胃蛋白酶等。酶水解的优点是:不产生消旋作用,也不破坏氨基酸。缺点是:使用一种酶往往水解不彻底,需要几种酶协同作用,才能使蛋白质完全水解。此外,酶水解所需时间较长。因此,酶水解法主要用于蛋白质的部分水解。
2.氨基酸的分类
从蛋白质水解产物中分解出来的常见氨基酸有20种。这些氨基酸(除脯氨酸外)在结构上的共同点是:与羧基相邻的α-碳原子上都有一个氨基,因而叫做α-氨基酸,它们的结构通式如下:
从氨基酸的结构通式可以看出,各种α-氨基酸的区别在于侧链上R基的不同。因此,20种氨基酸可以按照R基的化学结构或极性进行分类。
(1)按照R基的化学结构20种常见的氨基酸可分为脂肪族氨基酸、芳香族氨基酸和杂环氨基酸三大类。它们的分类和结构如下表所示。
表9 20种常见氨基酸的分类和结构
(2)按照R基的极性? 有些氨基酸的R基是亲水性的极性基,这样的氨基酸叫做极性氨基酸,如丝氨酸,它的R基含有一个亲水性的羟基,因此是极性氨基酸。其他的极性氨基酸有苏氨酸、半胱氨酸、谷氨酰氨、天冬酰氨、酪氨酸、赖氨酸、精氨酸、组氨酸、天冬氨酸、谷氨酸等。有些氨基酸的R基是疏水性的非极性基,这样的氨基酸叫做非极性氨基酸,如甘氨酸、丙氨酸、缬氨酸、亮氨酸、异亮氨酸、甲硫氨酸、脯氨酸、苯丙氨酸、色氨酸等(参见上表)。
3.蛋白质的化学组成、大小和分类
蛋白质的化学组成蛋白质的元素组成与糖类和脂质不同,除含有碳、氢、氧外,还有氮和少量的硫,有些蛋白质还含有其他一些元素,主要是磷、铁、铜、碘、锌和钼等。这些元素在蛋白质中的组成百分比约为下面各数值:
碳50%? 氢7%? 氧23%
氮16%? 硫0~3%
蛋白质元素组成的一个特点是:氮的含量较恒定。利用这一特点,可以进行蛋白质含量的计算。蛋白质含量=蛋白氮×6.25。上式中6.25是16%的倒数,即为1 g氮所代表的蛋白质量(克数)。
蛋白质的大小蛋白质是相对分子质量很大的生物分子。蛋白质相对分子质量变化的范围也很大,从大约6 000到1 000 000,有的还更大一些。某些蛋白质是由两个或更多个蛋白质亚基(多肽链)通过非共价结合而成的,称寡聚蛋白质。一些寡聚蛋白质的相对分子质量可高达数百万,甚至数千万。
蛋白质的分类蛋白质分子可按其分子的形状、分子组成和溶解度来分类。
根据分子的形状可将蛋白质分为两大类:球状蛋白质和纤维状蛋白质。血红蛋白、血清球蛋白、豆类的球蛋白等,分子似球形,都属于球状蛋白质;而指甲、羽毛中的角蛋白和蚕丝的丝蛋白等,形状似纤维,都属于纤维状蛋白质。
根据分子的组成可将蛋白质分为两大类:简单蛋白质和结合蛋白质。简单蛋白质的分子完全由氨基酸构成,如淀粉酶、核糖核酸酶、胰岛素等。结合蛋白质除了含有蛋白质成分外,还含有非蛋白质成分(即辅基),如血红蛋白、核蛋白等。
(1)简单蛋白质又可以根据其物理化学性质,如溶解度进行分类。根据溶解度可将其分为以下几类。
清蛋白(又叫白蛋白):溶于水及稀盐、稀酸或稀碱溶液,如血清清蛋白、乳清蛋白等。
球蛋白:微溶于水而溶于稀盐溶液,如血清球蛋白、肌球蛋白和大豆球蛋白等。
谷蛋白:不溶于水、醇及中性盐溶液,但溶于稀酸、稀碱,如米谷蛋白、麦谷蛋白等。
醇溶蛋白:不溶于水及无水乙醇,但溶于70%~80%乙醇。这类蛋白主要存在于植物种子中,如玉米醇溶蛋白、麦醇溶蛋白等。
鱼精蛋白:溶于水及酸性溶液,呈碱性,含碱性氨基酸(如精氨酸、赖氨酸、组氨酸)多,如鲑精蛋白等。
组蛋白:溶于水及稀酸溶液,呈碱性,含精氨酸、赖氨酸较多,如小牛胸腺组蛋白等。
硬蛋白:不溶于水、盐、稀酸或稀碱溶液。这类蛋白常常作为结缔组织和起保护功能的蛋白,如胶原蛋白,毛、发、蹄、角和甲壳中的角蛋白,以及腱和韧带中的弹性蛋白等。
(2)结合蛋白质可以
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