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A Thesis Submitted in Partial Ful?llment of the Requirements for
the Degree of Doctor of Philosophy in Engineering
Research on Models and Algorithms of Membrane
Computing for Solving Computational
Intractable Problems
Ph.D. Candidate : Niu Yunyun
Major
Supervisor
: System Analysis and Assembling
: Prof. Pan Linqiang
Huazhong University of Science Technology
Wuhan 430074, P. R. China
May, 2012
独创性声明
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研究成果。尽我所知,除文中已标明引用的内容外,本论文不包含任何其他人或集
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华 中 科
技
大
学
博
士
学
位
论
文
摘 要
膜计算是自然计算的一个新的分支。它是由细胞以及由细胞组成的组织或器官
的结构和功能得到启发,而抽象出来的一种计算模式。从“膜计算”的概念提出至
今十几年的时间里,关于膜计算的计算理论、模型、算法及应用得到了飞速发展。
膜计算为计算机科学提供了新的分布式并行信息处理方法和技术,促进了新型高性
能计算技术的发展,为求解计算困难问题提供了新的途径。类细胞膜系统和类组织
膜系统是膜计算模型的两种基本类型。本文主要研究了在这两种模型框架下求解计
算困难问题的膜计算算法。
计算有效性描述的是模型求解计算困难问题的能力,是自然计算中的一个关键
问题。膜计算模型基于常用的空间换时间的方法(通常使用受生物启发的操作,如
膜分裂、膜分割和膜创生),可以在多项式时间内求解计算困难问题。如何构造算
法在多项式时间内求解计算困难问题,特别是,NP 完全问题,PSPACE完全问题;
如何改进已有的结果,构造半统一形式(semi-uniform)的解与统一形式(uniform)
的解等都是值得研究的方向。本文对几个经典的NP完全问题— CAP问题、三匹配问
题、二次分配问题,给出了不同膜系统框架或不同规则使用模式下的算法,分析了
不同膜系统模型在计算中的表现。
空间换时间的膜计算算法尽管从理论上来说是正确的,但目前尚无真正意义上
的生物或物理实现。从算法实现的现实考虑,膜计算优化算法成为解决计算困难问
题的另外一种途径。它是膜系统框架与优化算法结合而成的,可以通过电子计算机
仿真实现,得到关于计算困难问题的近似解。本文分别构造了两类膜系统框架下的
膜计算优化算法,并将它们应用到路径规划领域,成功地求解了带容量约束的交通
路径问题和带时间窗的交通路径问题。膜系统提供的并行分布式计算模型、结构变
化方式和信息交流方式可以很好的改进传统优化算法的性能。主要工作如下:
首先,研究了带活性膜的膜系统框架下的算法设计。带活性膜的膜系统是类细
胞膜系统的一种重要类型。该模型在计算过程中往往包含膜结构的不断进化。早期
的带活性膜的膜系统是受电荷(+, ?, 0)控制的模型。但是,电荷的频繁变化不符
合生物实际,从计算的角度看,也浪费了大量的计算资源。对于一个经典的NP完全
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学
博
士
学
位
论
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问题――CAP问题,本文改进了P′erez-Jim′enez等人的已有结论,设计了不带电荷的情
况下,求解该问题的算法,并给出了由半统一形式的解到统一形式的解的改进。另
外,本文还研究了在极小并行的规则使用模式下如何求解该问题。特别地,这里首
次在极小并行的情况下,给出了无电荷的带活性
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