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我国汉族人群HLAⅠ类经典基因单倍型及连锁分析_医学论文
我国汉族人群HLAⅠ类经典基因单倍型及连锁分析_医学论文
作者:袁方, 孙玉英, 骆媛, 梁飞, 刘楠, 金荔, 刘金锋, 刘曙光, 奚永志【摘要】 本研究旨在探讨我国汉族人群HLAⅠ类经典基因座位HLA、HLA、HLA位点的基因频率,单倍型频率及连锁特征。采用序列特异性引物(SSP) PCR低分辨基因分型技术对1 014例随机选择的无关个体的经典HLAⅠ类位点进行基因分型,并对其相关遗传学参数进行统计学分析。结果发现汉族人群中较为常见的HLA类基因是A*02(0.33)、A*11(0.24)、B*15(0.14)、B*13(0.13)、Cw*03(0.25)、Cw*07 (0.18);较为常见的单倍型是A*02、A*11、A*02、A*11、B*46和B*13等,其中A*02、A*30、A*30、 A*02、B*46和B*58等单倍型呈现出显著的连锁不平衡;而A*0215、A*02、A*24、A*02、A*31等连锁不平衡性相对较低,其中A*24在重组事件中较常出现。此外,A*02、A*30、A*11、A*33、A*11、A*02、A*11等为常见扩展单倍型。结论: 本研究较系统地分析了我国汉族人群的HLA遗传学分布特点,为群体进化、临床移植及疾病相关研究等提供了有价值的遗传学资料。
【关键词】 遗传多态性
Abstract The aim of this study was to investigate the parameters of gene frequencies, haplotype frequencies and linkage disequilibrium of HLAinese Han population. HLAA, HLAB and HLACw loci were genotyped in 1014 unrelated China people using low resolution PCRSSP typing method, and their genetic parameters were analyzed by statistic methods. The results indicated that among all the detected HLAI genes, A*02(0.33), A*11(0.24), B*15(0.14), B*13(0.13), Cw*03(0.25) and Cw*07 (0.18) were the popular gene groups distributing in Chinese Han population, and A*02B*46(0.071), A*11B*15(0.051), A*02Cw*01 (0.084), A*11Cw*03(0.079), B*46Cw*01(0.095) and B*13Cw*03(0.071) were the predominant haplotypes in Han population. Additionally, A*02B*46, A*30B*13, A*30Cw*06, A*02Cw*01, B*46Cw*01 and B*58Cw*03 were statistically significant with strong linkage disequilibrium. While A*02B*15, A*02B*40, A*24Cw*03, A*02Cw*03 and A*31Cw*03 were in low linkage disequilibrium,among them A*24,A*02de useful genetic parameters for researches in colonial evolution, clinical transplantation and disease susceptibility.
Key words HLAⅠ gene genetic polymorphism gene frequency haplotype frequency linkage disequilibrium
J Exp Hematol 2007 15(5):1084-1089
人类白细胞抗原(HLA)是位于人类第6号染色体短臂上的一组紧密连锁的基因群,由HLAⅠ类、Ⅱ类、Ⅲ类基因组成,其编码产物可分布于不同类型的细胞表面,不但决定着宿主的组织相容性,而且参与宿主的免疫应答和免疫调节,其意义不仅限于移植免疫范畴,在机体防御外界细菌和病毒入侵以及自身免疫和某些传染性疾病相
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