计算化学相关的免费的在线数据库、分子结构库及工具.doc

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计算化学相关的免费的在线数据库、分子结构库及工具 这是和计算化学/分子模拟有关的免费的在线的库和工具,这类网站是很有意义的。下列网址于2009年7月8日验证皆可用,若无法访问可尝试代理。前面有√的代表比较重要。很多在线工具需要java运行环境。 1?在线信息数据库部分 √?SDBS光谱数据库:http://riodb01.ibase.aist.go.jp/sdbs/cgi-bin/direct_frame_top.cgi 简介:很好的有机化合物光谱数据库,包含六类光谱:EI-MS、FT-IR、H-NMR、C13-NMR、ESR、Raman。含3万余个化合物,其中以商业化学试剂为主,约2/3是6碳至16碳的化合物。数据大部分是其自行测定的,并不断添加。可以通过化合物、分子式、分子量、CAS/SDBS注册号、元素组成、光谱峰值位置/强度方式搜索。 生物核磁共振数据库:tein.osaka-u.ac.jp/deposit CRYSTAL程序基组数据库:http://www.tcm.phy.cam.ac.uk/~mdt26/crystal.html ?计算化学比较和基准数据库(CCCBDB): 简介:此数据库包括各种量子化学方法、各种基组下对不同分子的各种属性的计算结果,也包含实验数据。可用来对比不同方法计算结果优劣,此数据库内容在不断增加。 量化频率计算校正因子:/vibscale.asp 简介:实际上就是CCCBDB的一个子页面,比较重要故单独列出 IUPAC金属络合物稳定常数数据库:http://www.acadsoft.co.uk 注:需要付费,可免费下载试用版。 NIST化学数据库:/chemistry 简介:是美国国家标准与技术研究院NIST的基于Web的物性数据库。输入分子查找条件,可获得分子量、CAS登记号、各种热力学数据、谱图等信息,部分分子包含3D结构 RESP?ESP?charge?DDataBase(REDDB):/REDDB/index.php 简介:分子的RESP电荷的数据库 ppsala?Electron?Density?Server:http://eds.bmc.uu.se/eds 简介:用于评价蛋白质数据库中晶体结构电子密度。输入pdb?ID(比如1cbs)进入后可以对各种内容做图。点击EDS?Summary下面的Go按钮可以自动启动基于java的电子密度图可视化程序观看电子密度图,注意不要开启浏览器的弹出窗口过滤 上海有机所化学专业数据库:34/scdb/default.htm 简介:十分有用的数据库,免费注册。可获得分子的红外、质谱谱图、结构、物化性质、毒性、生物活性以及相关反应等。还包括中英互译、**名称检索等功能。 Clarkson大学相对论有效势数据库:/~pac/reps.html ?EMSL基组数据库:/bse/portal 含重原子全电子STO基组数据库:/Downloads/zorabasis/Welcome.html 原子间势参数数据库:http://www.dfrl.ucl.ac.uk/Potentials Stuttgart赝势参数数据库:http://www.theochem.uni-stuttgart.de/pseudopotentials/clickpse.en.html hemBioFinder:/chembiofinder/SimpleSearch.aspx 简介:根据分子质量、名称或者自行绘制结构,从几十万分子中搜索,得到二维结构、Smiles、InCHI字符串、分子量等简单信息。 Sigma-Aldrich公司产品数据库:/Area_of_Interest/The_Americas/United_States.html 简介:主要用来获得化合物IR、NMR谱图。右上角输入化合物的名字,搜索到后进入相应条目,如果在左侧有FT-IR?Raman、FT-NMR字样,就可以进入察看,没有则说明此化合物无光谱数据。也可以获得化合物的一些物性数据,但不全面。 基本物理常数数据库: 简介;可以查到精确的计算化学中涉及的物理常数及换算关系,如hartree->eV /cuu/Constants/index.html 百奧知识数据库: 简介:一个生物信息数据库的比较全的列表,每个数据库有简单官方介绍。 ttp:///html/sites/database/index.htm 2?结构数据库部分 GLYCAM寡糖数据库:/CCRC/Library/index.jsp ICSD无机晶体数据库:http://icsd.ill.fr/icsd/index.php 简介:免费在线提供部分晶体结构信息及cif文件。 NDB核酸数据库: 简介:根据NDB?ID,获得核酸坐标文件、出处等信息,

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wangshirufeng
该用户很懒,什么也没介绍

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