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应用表观遗传学位点检测孕妇血浆中的胎儿DN.pdf

·综述 · 应用表观遗传学位点检测孕妇血浆中的胎儿DNA 李 勤,,胡振林,综述,惠 宁,审校 (第二军医大学1.附属长海医院妇产科;;2.基础部遗传学教研室) 【摘要】随着对遗传病分子基础认识的不断深入和检测特异基因突变技术能力不断提高,为以 DNA检测为基础的产前诊断提供了理论和技术基拙,对胎儿DNA进行遗传分析已成为常规检测手段。 传统的产前诊断中获取胎儿组织样本的方法包括羊膜腔穿刺、绒毛膜取样、脐带取血等,这些方法均有 创伤性,对胎儿和孕妇都有一定的危险性。近年孕妇外周血中胎儿DNA的发现开创了非侵入性产前诊 断的可能性,同时母体血浆中相对高纯度和相对浓缩胎儿DNA技术发展促进了非侵入性产前诊断的临 床应用。但是,区分孕妇血桨中的母体DNA和胎儿DNA是关健,目前已发现有印迹基因、胎盘组织特 异性表达基因和病理情况下胚胎组织基因组特异性甲基化基因,这3类基因位点均可用于区分检浏孕 妇血桨中的母体DNA和胎儿DNAo 【关键词】胎儿DNA;母体DNA;表观遗传学 中图分类号:R737.33 文献标识码,A 文章编号:1004 -7379(2008)02 -0143 -03 目前,基于孕妇外周血中胎儿DNA的非侵人性产前检 非常不同的模式,这种不同的修饰如同基因被打上了印迹, 测已能做到明确胎儿性别以诊断性连锁疾病[I]和Rh血 被印迹的基因通常不能在子代表达,因此,子代的某些基因 型[[21,诊断强直性肌营养不良「’〕、软骨发育不全[’]和某些染 表达谱将取决于父本或母本,若父本(或母本)的等位基因被 色体异常〔s-7]等疾病。但以往对孕妇外周血中游离胎儿 印迹,则子代将只能表达母本(或父本)的等位基因。在生殖 DNA的应用多局限在检测胎儿从父亲一方继承来的基因或 细胞发育的早期,有一次整个基因组范围的广泛去甲基化、 突变,即检测的胎儿基因必须能与母亲DNA序列区分,这种 随后重新甲基化的过程,由于精、卵细胞发育上的差异,重新 限制性是由于母亲外周血中的胎儿DNA处于一种母体DNA 甲基化的差异将建立起精子和卵细胞不同的印迹基因。近 背景过多的环境中,这使检测从母亲继承来的胎儿等位基因 年的研究发现印迹基因在生长发育(尤其是胎盘的发育),甚 曾被认为是不可能的,但近年表观遗传学的研究提供了打破 至在大脑功能和个体行为中有重要作用。现在已知大约有 这种限制的可能。 80个基因在小鼠和人中是被印迹的。绝大多数印迹基因分 表观遗传是指DNA序列不发生变化但基因表达却发生 布在很广的染色体区域,这些区域的一些序列元件尤其是印 了可遗传的改变,即基因型未发生变化而表型却发生了改 迹控制区(imprinting control region, ICR)对于印迹基因的表 变,且这种改变在发育和细胞增殖过程中能稳定传递。DNA 达调控是十分重要的。ICR有几千碱基对(kb)长,富含CpG 甲基化是最早发现也是最重要的基因表观修饰方式之一, 岛,且DNA的甲基化只发生在两等位位点中的一方,因此此 DNA甲基化是在DNA甲基化转移酶(DNMTs)的作用下使 类区域又称作是差异性甲基化区域(differentially methylated CpG二核昔酸5端的胞嗜吮转变为5’甲基胞嗜吮。一般情 region, DMR)o IGF2-H19区域是位于7号染色体上一个被 况下,DNA甲基化能关闭某些基因的活性,去甲基化则诱导 深人研究的差异性甲基化区域,此区域中来源于父系的等位 了基因的重新活化和表达,这种DNA修饰方式并没有改变 基因被甲基化,而来源于母系的等位基因不被甲基化「1010 基因序列,但是它调控了基因的表达。 2002年Poon等〔11]选择人类IGF2-H 19区域做为模型进行母 近年表观遗传学研究发现,母亲和胎儿之间可能存在 亲和胎儿DNA甲基化差异性的研究,此研究表明IGF2-H19 DNA甲基化状态不同的基因位点至少有印迹基因、胎盘组织 位点父母双亲不同基因的甲基化差异,利用位于DMR之内 特异性表达基因和病理情况下胚胎组织基因组特异性甲基 的一个SNP(single-nucleotide polymorphism,单核昔酸多肤) 化基因,这3类基因位点均可用来区分检测孕妇血浆中的母 位点A/G,对母亲和胎儿标本同时进行PCR扩增,A/G杂合 体D

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