2-牛起源1.pptVIP

1研究的目的和意义 中国黄牛的起源进化与品种遗传多样性一直是国内外学者感兴趣的课题之一。 自上世纪80年代以来，为了追求一时的高产，我国大量引进欧美牛品种杂交改良，大量优良的和地方基因丢失，导致我国地方黄牛的遗传资源保护和研究变得非常重要。 及时全面研究我国黄牛的起源进化，多态类型、迁徙路线及其基因流向，提出黄牛品种遗传资源保存的策略，为中国地方黄牛的保种开发、杂交优势利用及肉牛新品种（品系）培育奠定分子遗传学基础。 why to select the d-loopregion of mtDNA? Firstly, evolution of mammalian mtDNA occurs primarily as single base pair substitutions, with only infrequent major sequence rearrangements (Wolstenholme 1992). Secondly, the rate of mtDNA evolution appears to be as much as 10 times faster than that of nuclear DNA (Brown et al. 1979). Thirdly, mtDNA is maternally inherited, haploid and non-recombining (Avise 1994). The D-loop region of mtDNA is known to be more variable in sequence than other regions (Cann et al. 1984) and thus has been frequently used for phylogenetic analyses of closely related groups 3 How to study? My major work 实验采集了25个省264份的血液样品，加上NCBI的GenBank下载的序列，形成了一个大数据库，包括来自东亚6个国家（中国，日本，韩国，蒙古，尼泊尔和印度）的894个D-loop序列。 中国，日本，韩国，蒙古，尼泊尔，印度 animal samples ： 实验方法： 1 样品的采集 2 黄牛血液样品采集后低温带回实验室，冻存于-70℃冰箱中。 3 DNA的提取与检测。采用Chen的方法提取DNA。 4 中国黄牛线粒体DNA D-loop及其他区域的PCR扩增 5 PCR产物的纯化与回收 6 线粒体DNA的测序(上海基隆生物工程公司) 分析软件： DNASTAR 7.0：Sequences are edited and aligned by DNAstar package. Mega 3.1：the polymorphisms in the analyzed segments are exported by using MEGA, and the phylogenetic trees are constructed. DnaSP4.0：The haplotype diversity (h) and nucleotide diversity (π) for the breeds or population samples are estimated. Network 4.1.1.2：The phylogenetic relationships among the clades were further demonstrated by the network. 印度瘤牛和中国瘤牛这种相互交叉的关系反应了它们之间的亲缘关系。古代瘤牛很可能是通过东南亚和印度迁移到了中国。随后中国瘤牛核心类群发展成为一个庞大的分支，经历了很长时间的分化，它成为了东亚瘤牛类群的代表。 常洪确认瘤牛的直系野生祖先是瘤原牛，瘤牛发源于印度半岛。 物种发源地往往保留的基因类型是最丰富的，但是基因的频率则会相应减少的规律，综合上面的分析，我们推测云南及其附近广西等地区可能是瘤牛进入中国的门户，也是中国瘤牛的起源迁移地。 中国北方黄牛以普通牛为主，其中蒙古牛，延边牛，长白地方牛和沿江牛都是普通牛类型，没有发现瘤牛个体。而由北向南，从中原地区开始中国黄牛出现了瘤牛个体，在南方黄牛中的瘤牛个体所占的比例更高，这说明瘤牛从南到北在影响中国黄牛，这与Lei等2006年的研究结论是一致的。 东亚瘤牛主要存在于中国的南方，本研究在北方牛品种中没有发现瘤牛类型，这与Mannen等在东北亚几个黄牛品种中几乎没有发现瘤牛类型的结论也是一致的。 中国瘤牛的迁移晚于普通牛，是属于自南向北的北迁。 西藏瘤牛的