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qPCR检测敲减效率实验方法.pdf
qPCR 检测敲减效率
实验方法
1/ 7
实验流程描述
培养生长状态良好的目的细胞,病毒感染前一天将目的细胞分入6-well 培养板培养,
感染当天按实验设计的组别加入RNAi 慢病毒颗粒进行目的细胞的感染实验。感染3 天后荧
光显微镜下观察GFP 表达情况,感染5 天后收集细胞,采用RT-PCR 的方法检测目的基因
的mRNA 表达情况,进而判断靶点的干扰效果。
流程图
2/ 7
实验材料:
1.主要试剂
REAGENTS COMPANY Cat.No.
Trizol Invitrogen 15596-026
M-MLV 逆转录酶 promega M1705
dNTP promega U1240
oligo dT 上海生工 B0205
Rnase Inhibitor promega N2115
Primer(RF) 上海吉凯
SYBR Master Mixture TAKARA DRR041B
胎牛血清 GIBCO A11-102
DMSO 上海生物试剂厂
DMEM GIBCO
胰酶 上海化学试剂公司
双抗 上海新先锋药业有限公司
Opti-MEM GIBCO
2 . 主要仪器
EQUIPMENTS COMPANY Cat.No
生物安全柜 上海振梓创空气净化有限公司 Bio 1200- Ⅱ-A2
荧光显微镜 奥林帕斯公司 micropublisher 3.3RTV
CO2 培养箱 日本三洋 MCO-175
稳压电泳仪 上海天能
PCR 仪器 ABI 公司 2720 thermal cycler
Real time PCR 仪器 TAKARA 公司 TP800
3/ 7
实验设计:
目的细胞慢病毒感染实验在6 孔板中进行,每孔样品排列如下表所示:
Group
Scr-siRNA gene-siRNA
results
2-ΔΔCt
说明:
1:Scr-siRNA 为正常目的细胞,加阴性对照病毒感染的细胞组(Negative Control);
2 :gene-siRNA 为正常目的细胞,加RNAi 靶点病毒感染的细胞组(Knock Down);
实验步骤:
1.准备靶细胞
1.1 细胞复苏
1) 从液氮罐中取出细胞冻存管
2) 迅速放入37℃水浴中,并不时摇动使其尽快解冻
3) 完全解冻后,1000rpm,离心2min
4) 70%酒精擦拭冻存管消毒后,移至超净台
5) 吸去冻存液上清,加入 1ml 新鲜的完全培养基重悬细胞,将细胞悬液接种至含有
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