地方鸡品种遗传多样性的微卫星标记研究.pdfVIP

维普资讯 2008年21卷3期 西 南 农 业 学 报 V0L21 No．3 SouthwestChinaJournal ofAgriculturalSciences 813 文章编号：1001—4829(2008)03—0813一o4 地方鸡品种遗传多样性的微卫星标记研究 崔景香 ，李传忠 ，孟祥凯 ，尹逊河 ，王 慧 (1．山东农业大学动物科技学院，山东泰安 271018；2．山东省Il缶沂市兰山区畜牧中心，山东 临沂 276000) 摘 要：采用微卫星标记技术检测了山东省3种地方鸡种：汶上芦花鸡、济宁百日鸡和 日照鸡的遗传多样性，在40种微卫星引物中 筛选出多态性丰富且扩增条带清晰稳定的6个引物。统计分析了各群体的等位基因数(^)、多态信息含量(mc)、平均杂合度 ()、群体间的遗传距离( )和相似系数 (，)。采用UPGMA法构建系统发生树。结果表明：3个地方鸡种在6个微卫星位点上共 发现了15个等位基因，每个位点的等位基因数为2—3个；每个群体的平均等位基因数分别为2．5、2．2和2；大小在 l10～300bp之 间，期望杂合度与观测杂合度比较接近。芦花鸡(w)多态信息含量最大，为0．3075；日照鸡 (R)中最小，为0．2915。以Nei氏遗传 距离进行UPGMA聚类分析，结果表明：百日鸡(J)与日照鸡 (R)间的遗传相似系数最大，为0．9832；遗传距离最小，为0．0170。3 个品种鸡可聚为2类，百日鸡(J)与日照鸡 (R)聚为一类，芦花鸡 (w)独立聚为一类。 关键词：遗传多样性；微卫星标记；芦花鸡；百日鸡；琅琊鸡 中圈分类号：$831．2 文献标识码 ：A Studieson geneticdiversityofShandongindigenous chickenbreedsusingmicrosatellitemarker CUIJing—ximlg。。LIChuan—zhong2MENGXiang—kai。，YIN Xun—he。WANGHui。 ， ， (1．CollegeofAnimalScienceandTechnology。ShandongAgriculturalUniversity，ShandongTai’an271018，China；2．AnimalHusbandry centreofShandongProvince，ShandongLinyi276000，China) Abstract：Thegeneticpolymorphismsof6micmsatelliteswereinvestigatedin3chikenbreedsinShandongprovinceinChina．Accordingto theallelefrequenciesof6microsatelliteloci，meanheterozygosity(H)，polymorphisminformationcontent(P，c)andgeneticdistances(DS) welecalculatdeforeachbreed。respectively．Theresultsshowde thatatotaloffi衄 alleleswel~found，ofwhich1to3allelesOCCUlTedateach loci，andthemeanalleleswas2．5，2．2nad2，respectively．Theexpectde heterozygositywa$hisherthanobservde heterozygesity．Themean PICofLuhuachickenwa$thehighest(0．3075)，andthatofRizhaoch