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基于多参数距离融合聚类原理建立中药标准指纹图谱的研究.pdf

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基于多参数距离融合聚类原理建立中药标准指纹图谱的研究.pdf

高技术通讯2014年第24卷第1期:99—103 doi:10.3772/j.issn.1002-0470.2014.01.015 基于多参数距离融合聚类原理建立中药标准指纹图谱的研究① 崔建新②一+ 崔建凤”+ 洪文学+ 高海波③一“’ ‘燕山大学电气工程学院 秦皇岛066004 ”河北省测试计量技术及仪器重点实验室秦皇岛066004 ”+秦皇岛职业技术学院旅游系秦皇岛066004 ””中国中医科学院针灸研究所北京100700 摘要分析了中药标准指纹图谱的传统构建方法,针对传统方法建立的中药标准指纹 图谱在中药质量鉴别及评价上的局限性,进行了标准指纹图谱建立方法研究,提出了基于 多参数距离融合聚类原理建立中药标准指纹图谱的方法。该方法通过计算中药多维多患 图谱数据的各维特征聚类规则并融合在一起获得中药标准指纹图谱,实现了多种图谱信 息的融合。采用黄芩数据进行了实验,实验结果显示依据聚类原理构建的中药标准指纹 图谱更利于中药的分类。该方法是一种可行的中药标准指纹图谱构建方法。 关键词 中药指纹图谱,聚类分析,信息融合,可视化 经过鉴定的药材样本作为对照品,构建该品种药材 0 引言 的标准指纹图谱。也可以将道地产区的样品或严格 按GAP 中药材生产质量管理规范认证管理办法 中药现代化是目前国内外医药界研究的一大热 要求生产的药材样品作为标准品进行对照。中药指 点¨J。中药指纹图谱技术是实现中药现代化的有 纹图谱标准图谱的建立,对于中药指纹图谱数据处 力工具【2J。任何药物,只有达到一定质量标准才能 理准确度的提高具有重要的指导作用,有利于形成 产生一定疗效。药物质量的优劣直接关系到疾病的 对中药材或中成药的客观准确的鉴定或评价。而中 治疗及患者的健康和生命安全【3引。而中药由于其 药的鉴别与评价最终都归结为分类问题,所以本文 化学成分的多样性、复杂性以及有效成分的不均衡 基于分类目的,提出以多参数距离融合聚类规则作 性,使得中药分类和质量研究的任务极其艰巨。中 为评价与鉴别标准,也就是标准指纹图谱不再是传 药指纹图谱可以用来鉴别中药的真伪、控制中药质 统意义上的有形的特征指纹图谱或有实际意义的特 量及评价其安全性和有效性。中药指纹图谱的解析 征库,而是一种以分类为目的的聚类规则。由于以 与处理通常是指,借助于计算机,分析其化学成分测 分类为目的,以分类结果准确率高的聚类规则来定 定值及相关的药理作用,快速、准确地寻找出内在规 义标准指纹图谱,所以用这种方法构建的标准指纹 律,作为中药材质量控制的指标【6’7]。 图谱更利于指纹图谱的分类,同时在基因研究方面 中药指纹图谱的标准图谱,又称为共有模式,是 更有广泛应用¨。1…。 指能够表征某种中药产品化学组成特征的一个图 谱。在中药的鉴别与评价以及中药指纹图谱数据处 1 中药标准指纹图谱传统构建方法 理中,标准指纹图谱可以作为参照图谱。将待测试 的指纹图谱与标准指纹图谱进行对比匹配,可以得 常用标准指纹图谱构建方法主要有三种: 到测试样本的质量评价结果。对于中药材,可以把 1 典型指纹图谱选择法,即通过对一组或一 发展计划 201001All9 资助项目。 ②女,1977年生。博士;研究方向:模式识别,中药指纹图谱;E.mail:ydcuijianxin@yahoo.eom.cn ③通讯作者,E—mail:hhshb@ysu. 收稿日期:2013-05-27 一99— 万方数据 高技术通讯2014年1月第24卷第1期 系列样品的指纹图谱进行研究,并结合待测样品的 法,并依据相似度对样本的多维特征进行聚类。最 性状以及其它理化鉴别方法,从样品中选择一个具 后,训练分类器,并选择鉴别效果较好的距离计算方 有代表性或者是有典型意义的指纹图谱来作为对照 法,得到多个距离分类规则,将多维距离分类规则融 指纹图谱,构建出该品种的标准指纹图谱。当各个 合在一起就组成了标准指纹图谱。 样品的指纹图谱特征相近时,这种方法值得推荐。 图1为标准指纹图谱生成示意图。A,曰,…为 但是由于选择的典型指纹图谱只包含单个样品的特 多维多息图谱数据表征的样本。ADA酊;BDB“;… 征,所以选择过程难以避免随意性。而且,在各个样 分别表示样本的保留时间、相对保留时间、峰面积和 品的指纹特征差异比较大的情况下,典型指纹图谱 归一化峰面积,m表示样本的变量个数。t,S分别表 的选择比较困难。 示保留时间和峰面积的聚类规则,它们是各个矩阵的 2 共有模式生成法。共有模式指的是每个指 相应行聚类的规则,如A。与B。的聚类,然后得到矩阵 纹图谱都包含的广义谱峰,它可能是一个真正的谱 日为总的聚类规则,即为我们的标准指纹图谱。 峰,也可能是一段区域,

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