基于本体生物信息集成研究.pdfVIP

18 2008，44(专刊) and ComputerEngineering Applications计算机工程与应用 基于本体的生物信息集成研究 林毅，宁 洪，王挺，刘文杰 LIN Yi，NINGHong，WANGTing，LIU Wen-jie 国防科学技术大学计算机学院，长沙410073 of ofDefense 410073，China University CollegeComputer，National Technology，Changsha E-mail：linyil9820804@163．corn LINYi．N1NG a1．Researchof basedbio-information Hong，WANGTing，et ontology integration．ComputerEngineering and Appfications。2008—11(专刊)：18—20． Abstract：Toresolvethe ofsemantic inbio-information current problem heterogeneity integration，thebio-ontologicalknowledge the baseddata andits inbio-informationare wecombinemediator usages integrationpresentedfirsdy．Then integrationapproach with and an basedbio-information distributedenvironments．Also，its ontologyproposeontology integrationplatform(MOBlB)in key ale anddiscussed．InMOBlB hasbeenusedinseveral in componentsanalyzed platform，theontologicalknowledge importantsteps thestructural and over datasoUrCes．Therefore，itcanresolve queryingmultiple heterogeneity，semanticheterogeneityterminology inbio—information discrepancy integrationpreferably． Keywords：bio--ontology；dataintegration；heterogeneity；bioinformaties 摘要：为了解决传统生物信息集成在语义处理中的困难，首先分析了现有生物学本体知识及其在生物信息集成中的作用，然后 将传统的基于中介模式的数据集成方法和本体技术相结合，提出了分布式环境下基于本体的生物信息集成框架(MOBIB)并对其 中的关键模块进行了分析和讨论。MOBIB把本体应用于对多数据源查询处理的各个阶段，能较好地解决生物信息集成中存在的结 构异构、语义异构、术语异构等问题。 关键i司：生物本体；数据集成；异构；生物信息学 l 文献标识码：A 中图分类号：TP31 l引言