人类基因组中的CpG岛上的所有甲基化区段的测定.docVIP

人类基因组中的CpG岛上的所有甲基化区段的测定 摘要：CpG岛的甲基化在各种生物过程中发挥了重要作用。为了探讨人类基因组中CpG岛上所有区段的甲基化，我们运用一个模型测定CpG岛上甲基化区段。从这个模型进行其他现有的方法。我们在整个人类基因组运用该模型并且测定CpG岛上所有甲基化的区段的。基于轮廓的甲基化，我们发现大约31%的CpG岛倾向于甲基化而且，位于启动区CpG岛很少甲基化。在染色体G带和R带之间CpG岛的甲基化水平没有显著不同。在抵制甲基化的启动子CpG岛上，RNA聚合酶II的含量有显著提高，这表明有这样的启动子CpG岛的基因倾向于更加活跃。 关键词:DNA甲基化区段；CpG岛；测定模型；特征选择 在哺乳动物中，DNA甲基化是一个主要的表观遗传修饰。在各种各样的生物现象包括胚胎发育、基因组印记和X-chromosome失活中都需要它。在哺乳动物中,DNA甲基化受限于残留在CpG二核苷酸中的胞嘧啶。虽然在人类基因组中大多数CpG二核苷酸是被甲基化的，但是CpG岛(CGIs)在正常的体细胞组织中是完全抗甲基化的。根据Gardiner-Garden序列的标准,一个CGI是一个G和C含量高的区域，以及观察与预期的CpG的比率：G+C含量超过50%，观察与预期的CpG的比率超过0.6并且长度高于200bp。 近年来,有越来越多的证据表明一些CGIs在正常组织中事实上是甲基化。