HyperChem程序及其应用.doc

河北师范大学计算量子化学研究所蔡新华教授量子化学在线教学00/qc/lzhx-0.htm HyperChem 程序及其应用 一、HyperChem 程序的运行环境 HyperChem 程序包，用C++写源程序， 可以通过网络选购HyperChem程序包，也可以免费下载演示版本以供学习只用，现在该公司提供的最新版本为V6.0。 该公司的网址为： 该公司与98年诺贝尔奖金得主Pople的关系可以参看其网页有关介绍。 1、软件环境 Windows95、Windows98或Windows2000系统。 2、硬件环境 486以上的微机，内存应在8M以上，硬盘至少有32M以上自由空间。 为了能够以最佳方式显示分子图像，最好有VGA以上显示器。 3、程序安装 使用该程序应注意程序版权（注册）。 安装程序默认子目录为：C:\hyper6 安装完成后，该目录可以看到如下文件，其中，绿色烧杯为执行程序图标。 有关该程序的使用说明、参考手册等全套文档均可免费获得。 二、程序基本使用方法 我们以演示版本为例，说明该程序的基本使用方法。 1、启动程序 在屏幕上，双击绿色烧杯可以得到如下画面： 点击 Try进入工作区窗口 窗口各部分功能简介 标题名称：最大、最小化、退出按钮 菜单 条： FILE、EDIT、BUILD、SELECT、DISPLAY、DATABASE、 SETUP 、COMPUTE、CANCEL、SCRIPT、HELP 工具 条： 工作 区： 状态 行： 2、打开已存在的数据文件 File-Open 选择分子图形的显示方式 Display- Labels可以选择原子、化学键等标记方式： Dispay-Rendering Renderings-Balls Rendering—Balls and Cylinders 3、建立计算分子的数据文件 以丁二烯为例： 选择Build-Default Element 可以显示指定元素的基本性质： 选择绘图工具后，得到碳碳骨架。左键、右键增减键序 把2D骨架转换为3D图像 Select 选定原子后，状态行提示原子标号、坐标等结构信息。 保存为数据文件 如需要修改原子骨架，比如把某个氢原子改为氯原子： 选定缺省元素后，在指定原子位置上双击即可。 移动、旋转、放大、缩小分子图像 此时，可以用Build—Set设定初始数据，如键长、键角、形式电荷等等。 也可以用来直接测定分子构型数据 三、优化分子构型 1、丁二烯分子体系能量极小值的计算 记录输出结果： FILE---START LOG…. 绘出丁二烯分子骨架模型:DRAW 测量键长、键角、二面角等结构信息：SELECT 用半经验方法优化分子构型 SETUP--CNDO COMPUTE---GEOMETRY 测量键长、键角、二面角等结构参数。 对给定体系优化构型后，可对优化后的构型再进行单点计算。 ? 计算结果的输出文件 HyperChem log start -- Sun May 28 21:38:15 2000. Geometry optimization, SemiEmpirical, molecule = (untitled). CNDO PolakRibiere optimizer Convergence limit = 0.0001000 Iteration limit = 50 Accelerate convergence = YES Optimization algorithm = Polak-Ribiere Criterion of RMS gradient = 0.0100 kcal/(A mol) Maximum cycles = 150 RHF Calculation: ? Singlet state calculation Number of electrons = 22 Number of Double Occupied Levels = 11 Charge on the System = 0 Total Orbitals = 22 ? Starting CNDO calculation with 22 orbitals ? E=0.0000 Grad=0.000 Conv=NO(0 cycles 0 points) [Iter=1 Diff=7144.22066] E=0.0000 Grad=0.000 Conv=NO(0 cycles 0 points) [Iter=2 Diff=5.36263] E=0.0000 Grad=0.000 Conv=NO(0 cycles 0 points) [Iter=3 Diff