Mapping Databases.PPT

Introduction Genomic mapping (基因體圖譜) Physical maps （物理圖譜） constructed from DNA sequence or DNA clones Genetic map, cytogenetic map （遺傳、細胞質遺傳圖譜） A gene, a genomic variation, a disease locus Molecular signature Major bioinformatics challenges 大量的基因體序列可有效率取得 這些資訊已經轉移到網路資料庫中 Relationship Between Mapping and Sequencing 序列與圖譜之間區別一直不是很清楚 一大片段的序列可當成高解析度圖譜 Ex: bp 247 of the PGD gene; between D1S450 and D1S228; 1p36.2 Anonymous DNA marker, a gene, or a DNA clone 將大DNA序列加上位置註解，再放入圖譜中 隨著真核生物基因組的定序陸續完成，圖譜與序列間的排序將以序列為中心 染色體定序完成前的圖譜 Marker-based, gene-based tags Ex: expressed sequence tags ESTs, STSs sequ