Protein ABC.ppt

二級結構:b-sheet b-sheet的b表示這是第二種規則的二級結構,呈現摺板狀,如同a螺旋,亦靠重複的q與y角形成大量的氫鍵以使結構穩定。 二級結構:b-sheet(續) 和a-螺旋不同的是,b-摺板並不一定要在一級結構(序列)上連續,而是各片段可以來自不同的一級結構區,而且相較於a-螺旋的緊密結構,b-摺板是完全伸展的。 超二級結構 (Supersecondary Motifs) 許多球蛋白中,a-helix或b-sheet二級結構可以形成所謂的「超二級結構」,在不同的蛋白質中重複出現。 三級結構(Tertiary Structure) 三級結構描述各二級結構單元之空間關係。大蛋白質的二級與超二級結構常組成「domain」,此為由polypeptide骨架連結之緊密單元,其功能與折疊常獨立於其他domain。三級結構描述這些domain的關係以及蛋白質折疊讓序列中距離遙遠的氨基酸互相靠近的途徑,以及使其構形穩定的鍵結。 四級結構 (Quaternary Structure) 當蛋白質的polypeptide chain不只一條,各鏈之間藉由非共價鍵連結時,會有四級結構,也就是鏈與鏈之間的相關位置。 蛋白質分子結構與自由度 自由度:每個原子在空間中有三個自由度(degrees of freedom),即 XYZ 三個方向,若分子由 N 個原子組成,則有 3N 個自由度,整個分

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