代谢组学技术在医学研究领域中的应用.pdfVIP

页 1 代谢组学技术在医学研究领域中的应用 代谢组学 （Metabolomics ）是通过考察生物体受扰动或刺激前后大量代谢产物的动态变化, 进而阐 明生物体代谢相关过程的一种组学技术。其研究对象主要是相对分子质量1000以下的内源性小分子代 谢物。相比于其他组学，代谢组学的研究优势和特点包括：①基因和蛋白表达的微小变化会在代谢物 水平得到放大，生物体液的代谢物分析可更为 准确、有效地反映机体的生理和病理状态。因 此，通过代谢组学研究既可以发现生物体在受 到各种内外因素、处理等扰动后的应答不同, 也可以有效地区分同种不同个体之间的表型差 异；②代谢物的种类远少于基因和蛋白质的数 目，代谢组学的研究不需进行极大规模的数据 库构建；③对多数小分子内源性代谢产物的作 用及其所在代谢通路、代谢调控已有相当的认 识。 相对于磁共振技术（NMR ）灵敏度低、检 代谢生理 研究方面，Long等发表在2011年 测动态范围窄等缺点, 质谱（MS ）具有较高的 《Nature Chemical Biology》上的研究，利用代 灵敏度和专属性, 可以实现对多个化合物的同时 谢组学的方法发现了一个新的磷脂酶ABHD3 (α/ 快速分析与鉴定,。越来越多的研究者将色谱-质 β-hydrolase domain–containing 3) (1) 。作者首 谱联用技术（LC-MS和GC-MS）用于代谢组学 先将一系列尚未验证的代谢酶转染入HEK293细 的研究。随着相关方法与技术的成熟与发展， 胞内；然后，利用LC-MS 的代谢组学技术分析了 基于质谱技术的代谢组学在 医学基础研究、药 这些酶过表达前后细胞的代谢组改变。通过比较 物研发、临床诊断与治疗等领域已经得到十分 代谢物的差异表达，作者发现ABHD3 的过表达对 广泛的应用。 C-18 LPC （C18-lysophosphatidylcholine ）的生 成有明显影响。作者进一步利用MRM 的靶向代 谢组的方法对其他LPCs 的表达增加以及C14-LPC ◆ 代谢组学在医学基础研究中的应用 表达的减少进行了绝对定量验证。MRM 的实验 通过描绘生理条件下代谢物的整体组成和变 同 样 发 现 ： 过 表 达 ABHD3 后，细 胞 内 PLA1 化，可以深入揭示细胞或生物体的代谢过程和 (phospholipase A1)和PLA2 (phospholipase A2) 的生成分别增加了17倍和3倍。 以上结果表明， 代谢调节机制等；通过大规模分析机体的代谢 ABHD3是一个新的myristoyl-PCs磷脂酶。在此基 物扰动和改变，可全面和系统地了解肝病、糖 础上，作者研究了Abhd3 敲除动物的代谢组改 尿病、肿瘤、心血管、神经等疾病的病理变化 变，进 而证实在 体条件 下 ABHD3 参与了 C14- 与机制，以及评价正常人群的营养和健康状况 phospholipids (C14-PLs)的水解过程，ABHD3能 等。基于代谢组学的研究还能够为传统中医病 够选择性地剪切中间链及氧化截断的磷脂。 利