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CTAB配方及植物DNA提取方法.doc
主要试剂的配制
参考(美)萨姆布鲁克(Sambrook,J.)等.分子克隆实验指南(下册)配置如下[94]:
(1)0.5 mo1/L EDTA(pH 8.0):称取EDTA-Na2 18.61 g,加80 mL双蒸水,磁力搅拌器上剧烈搅拌。加入7 mL 10 mo1/L NaOH调至pH 8.0再用双蒸水定容到100 mL,在1.03×105Pa下高压灭菌20 min。
(2)5 mol/L NaCl溶液:称取NaCl 29.22 g,溶解于90 mL的双蒸水,加热到80℃溶解,冷却,再用双蒸水定容100 mL,在高压灭菌20 min。
(3)10 mol/L NaOH溶液:称取40.00 g NaOH溶于80 mL的双蒸水,搅拌,定容到100 mL。
(4)1 mol/L Tris-HC1溶液(pH 8.0):称取12.114 gTris碱,溶于80 mL的双蒸水,加入浓HC1 4.2 mL,调整PH值到8.0,加水定容到100 mL,高压灭菌20min。
(5)10%CTAB(m/v):称取CTAB 10.00 g,溶解于80 mL的双蒸水,加热促进溶解,加双蒸水定容到100 mL,室温保存。
(6)5 mo1/L KAc溶液(pH 4.8和6.5):分别称取KAc晶体49.07 g,溶于80
mL的双蒸水,再用冰乙酸调至pH 4.8和6.5,加双蒸水定容到100 mL,在1.03×
105Pa下灭菌20 min。4℃保存。
(7)3 mo1/L NaAc·3H2O溶液(pH 5.2):称取NaAc晶体20.412 g溶解于约30 mL的双蒸水,用冰乙酸调至pH 5.2,加双蒸水定容到50 mL,高压灭菌20 min。4℃保存。
(8)提取缓冲液(0.4 mol/L葡萄糖,3%PVP,2%β-巯基乙醇)250 mL:称取葡萄糖19.817 g、PVP 7.50 g,加水溶解并定容到250 mL,在1.03×105Pa下灭菌20 min,β-巯基乙醇现用现加。4℃保存。
(9)裂解缓冲液(3%CTAB;100 mmo1/L Tris-HC1,pH 8.0;20 mmo1/LEDTA,pH 8.0;1.4 mol/L NaCl;2%β-巯基乙醇)100 mL: 取10%CTAB 30 mL,加1mol/LTris~HC1(pH 8.0)10 mL,加0.5 mo1/L EDTA(pH8.0)4 mL,加5 mol/LNaCl 28 mL并定容到100 mL,高压灭菌20 min,β-巯基乙醇现用现加。
(11)TE缓冲液(10 mmo1/LTris-HC1,pH 8.0;1 mmo1/L EDTA,pH 8.0):取Tris-HCl溶液(pH 8.0)1 mL,EDTA(pH 8.0)0.2 mL,用双蒸水定容到100 mL,高压灭菌20 min。4℃保存。
(12)电泳缓冲液TAE(Tris-乙酸)的配制
50×TAE母液的配制:242.0 g Tris-Bace、57.1 mL冰乙酸、100 ml 0.5mo1/L EDTA(pH 8.0),用双蒸水空容至1000 mL。
1×TAE电泳缓冲液的配制:取50×TAE 10 mL,再加入490 mL双蒸水,定容至500mL
方法
丝瓜DNA的提取与纯化
CTAB(十六烷基三甲基溴化铵)法从预处理过的丝瓜叶片中取出一到两片,做好标记备用:
(1)称取1.5 g丝瓜预处理过的嫩叶片于预冷研钵中,置于液氮中,迅速研磨三到四次成粉末状。
(2)将粉末状材料转入10 mL的灭菌离心管中,立即加入3 mL 65℃预热的裂解缓冲液和60μL的β-巯基乙醇,充分混匀,在65℃水浴中保温45 min间摇动离心管三到四次)。
(3)加入等体积的酚/氯仿/异戊醇(V/V/V=25/24/1),轻轻颠倒离心管匀,上部呈乳状液为止,室温下12000 r.min-1离心10 min。
(4)取上清液至10 mL的灭菌离心管中,加入等体积的氯仿/异(V/V=24/1),轻轻颠倒离心管,混匀,室温下12 000 r.min-1离心10 min。
(5)把上清液转移到10 mL的灭菌离心管中,加入2/3倍体积并于-20°C预冷的异丙醇,轻轻晃动,于-20℃静置30 min。
(6)4℃下8000 r.min-1离心5 min,收集沉淀。倾去上清液,用75%(的乙醇漂洗沉淀2次(每次1 mL),将离心管倒置在吸水纸上,风干。
(7)沉淀用50μL TE缓冲液溶解,并加入0.5μL 10 mg/mL RNase,使RNA酶的终浓度为10μg/mL,轻轻混匀,于37℃水浴中温浴45~60 min。
(8)在离心管加入TE缓冲液300μL,再用等体积的氯仿/异戊醇(V/V=24/1)
抽提,轻缓颠倒混匀,于4℃
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