KNN方法在癌症中红外光谱检测中的应用.pdfVIP

维普资讯 第27卷 ，第3期 光 谱 学 与 光 谱 分 析 Vo1．27，No．3，pp439—443 2007年 3月 SpectroscopyandSpectralAnalysis March，2007 KNN方法在癌症中红外光谱检测中的应用 李 响 ，李庆波 ，徐怡庄 ，张广军 ，吴瑾光 ， 杨丽敏 ，凌晓锋。，周孝思。，王健生 1．北京航空航天大学仪器科学与光电工程学院，北京 100083 2．北京大学化学与分子工程学院，稀土材料化学及应用国家重点实验室，北京 100871 3．北京大学第三医院普外科，北京 100083 4．西安交通大学第一医院外科，陕西西安 710061 摘 要 红外光谱主要是研究分子中以化学键联结的原子之间的振动光谱，它能够在分子水平上揭示正常 组织和癌组织之间存在的差异。文章利用化学计量学中的有关知识通过计算机 自动对未知样本光谱进行判 别分析。首先应用平滑处理，基线校iE(SNV方法)，奇异值剔除(RHM方法)等算法对光谱数据进行预处 理，然后采用K一最近邻法(简称KNN法)实现未知样本的自动判别，提高了癌症红外光谱检测的准确度。文 章对63例胃组织样品进行了傅里叶变换红外光谱判别分析，与病理检验结果比较，准确度达到91．7％。 关键词 KNN方法；癌症 ；FTIR 模式识别 中图分类号：R730．4 文献标识码：A 文章编号：1000—0593(2007)03—0439—05 果 。 引 言 对试样组织进行光谱分析所用的数据是多维的，其中包 含着丰富的光谱特征信息，计算机对多维数据具有很强的模 癌症是一种严重危害人类健康乃至生命的疾病，它的发 式识别能力，因此本文以胃癌组织的傅里叶变换红外光谱检 生是一个多因素、多阶段 、复杂渐进的过程。早期发现，早 测为例，对胃癌和癌旁正常组织的傅里叶变换中红外光谱进 期诊断，早期治疗是提高病人生存率的关键。在组织癌变过 行了KNN方法的模式识别应用研究，以进一步提高恶性肿 程中，分子水平上的变化一般早于细胞形态学方面的变化和 瘤中红外光谱早期诊断方法的判别效果。 机体症状的出现，然而现有影像学技术对分子水平上的变化 不敏感，难以利用这些变化诊断早期癌症。振动光谱法能够 1 实验部分 灵敏地检测细胞分子生物化学上的变化，如探测细胞的生物 分子在构型、构象和含量上发生的变化，它在癌症形成初期 1．1 标本取材和处理 就可以观察到分子结构的细微改变，同时由于肿瘤细胞内部 样品为北京大学第三医院和西安交通大学第一医院外科 物质在分子水平发生典型变化，所以红外光谱具有一定的客 手术切除标本，胃癌组织及 胃正常组织共计63例，病理学检 观性和可重复性。因此，红外光谱法可以发展成一种简便、 查结果为胃癌37例，正常胃组织26例。标本离体后，样品 快速、准确的癌症早期诊断方法。 分为两部分，一部分福尔马林固定，石蜡包埋，HE染色，进 近年来，随着光谱技术与生物谱学研究的发展，光谱方 行常规病理学检查；另一部分放入液氮中保存，用于光谱研 法应用于肿瘤检测的研究逐渐成为国内外的热点课题_1]。 究。 近年来应用中红外光谱法检测肿瘤的研究取得 了长足的进 1．2 仪器和方法 步。其中北京大学化学与分子工程学院分子光谱组率先提出 样品在室温下解冻后，采用美国 Nicolet公司生产 的 在组织层次研究肿瘤与正常的临床样品，并在肿瘤检测的实 Magna750I1型傅里叶变换红外光谱仪和中红外MCT探测 验方法探索、