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- 2017-08-18 发布于安徽
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琼脂糖凝胶电泳:胶浓度与DNA长度的关系
2010年1月22日
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Biology
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分离不同大小的DNA片段所用的最适凝胶浓度是不同的,数据见下表。
凝胶浓度(%) 线性DNA长度(bp) 0.5 1000~30000 0.7 800~12000 1.0 500~10000 1.2 400~7000 1.5 200~3000 2.0 50~2000
①切胶回收DNA片段是要把整个目的片断所在位置的胶全部回收。所以为了减少胶的体积,我们就可以用相对比较薄的胶来跑电泳,通常只要够点样即可,或是采用薄而宽的梳子来跑胶。这样可减少回收试剂引起的一些后续麻烦。
②主要还是DNA的浓度, 如果DNA浓度不够, 想胶小点也不可能。
③紫外灯下切下含待回收DNA的凝胶时,要衬以干净的塑料薄膜,使用无DNA污染的新刀片,其目的在于防止外源DNA的污染。
④利用凝胶回收试剂盒DNA回收效率较低或者未回收到目的片段可能有以下几个原因:胶块未完全溶解,可适当延长水浴时间,并增加上下颠倒次数辅助溶解;胶块体积太大,应先将其切为小块,分多次回收;电泳缓冲液pH太高,硅基质膜在高盐低pH结合DNA,如pH太高,应作适当调整;漂洗液中未加入无水乙醇。
⑤可以改用去离子水洗脱。但是实验室所用纯水一般pH偏低,可利用NaOH适当调高其pH值,以增加洗脱得率。
⑥洗
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